136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1897 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1897  Methyltransferase regulatory domain, predicted  100 
 
 
564 aa  1159    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1624  Methyltransferase type 12  35.6 
 
 
542 aa  293  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  37.28 
 
 
1144 aa  282  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  39.78 
 
 
1143 aa  252  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0579  methyltransferase  40.82 
 
 
523 aa  241  2.9999999999999997e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.795709  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1482  putative methyltransferase  33.75 
 
 
514 aa  236  8e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1377  Methyltransferase type 12  32.22 
 
 
494 aa  232  1e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2284  dimethyladenosine transferase  38.49 
 
 
518 aa  225  2e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3960  methyltransferase type 12  33.69 
 
 
535 aa  222  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00884367  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2812  methyltransferase type 12  31.46 
 
 
535 aa  214  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1600  para protein  39.5 
 
 
486 aa  210  5e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1678  putative methyltransferase  36.71 
 
 
508 aa  206  8e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1668  methyltransferase type 12  35.42 
 
 
535 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0697  hypothetical protein  37.34 
 
 
509 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1637  methyltransferase, putative  34.15 
 
 
521 aa  189  1e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  29.11 
 
 
1116 aa  185  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1732  hypothetical protein  39.27 
 
 
503 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.228081  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0277  SAM-dependent methyltransferase  35.8 
 
 
482 aa  180  7e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1912  methyltransferase type 12  31.61 
 
 
419 aa  166  8e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2369  Methyltransferase type 12  37.06 
 
 
252 aa  148  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631765 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0362  methyltransferase type 12  28.62 
 
 
518 aa  101  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72532  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0475  methyltransferase type 12  25.67 
 
 
499 aa  94.4  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0031  hypothetical protein  26.28 
 
 
510 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.878298  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1222  hypothetical protein  27.2 
 
 
499 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0351348  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0189  hypothetical protein  27.2 
 
 
499 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0465  hypothetical protein  27.2 
 
 
499 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1462  hypothetical protein  27.2 
 
 
499 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1110  hypothetical protein  27.2 
 
 
499 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1398  hypothetical protein  27.64 
 
 
590 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2605  hypothetical protein  26.78 
 
 
499 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1375  hypothetical protein  26.78 
 
 
499 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3839  methyltransferase type 11  27.31 
 
 
511 aa  82.8  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0810259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1066  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
511 aa  76.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3078  methyltransferase type 12  24.81 
 
 
512 aa  75.9  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2227  hypothetical protein  23.2 
 
 
514 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.642129  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37000  SAM-dependent methyltransferase  33.93 
 
 
488 aa  62.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0432577  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
440 aa  57.4  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  30.25 
 
 
399 aa  54.7  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  26.97 
 
 
439 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 
283 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  29.55 
 
 
399 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  30.1 
 
 
403 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.68 
 
 
447 aa  51.2  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  25.97 
 
 
444 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  27.73 
 
 
395 aa  50.8  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2035  16S rRNA methyltransferase GidB  28.3 
 
 
221 aa  50.4  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00382628  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  31.62 
 
 
226 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4011  methyltransferase type 12  26.32 
 
 
317 aa  50.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.550687  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 
779 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.06 
 
 
346 aa  49.3  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  27.43 
 
 
422 aa  49.3  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  23.31 
 
 
779 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  27.43 
 
 
400 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6936  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.61 
 
 
343 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389274  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  26.17 
 
 
278 aa  48.5  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  24.46 
 
 
390 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  31.36 
 
 
223 aa  48.5  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  30.1 
 
 
269 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  30.43 
 
 
284 aa  47.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  28.07 
 
 
865 aa  47.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1968  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  32 
 
 
382 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000279538 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  31.07 
 
 
236 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01632  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase (unsaturated-phospholipid methyltransferase)  32 
 
 
382 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1979  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32 
 
 
382 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157021  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  24.09 
 
 
580 aa  47.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0353  methyltransferase type 12  27.72 
 
 
300 aa  47.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0874936 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  27.43 
 
 
400 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1741  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  32 
 
 
382 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000985  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1875  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  32 
 
 
382 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000001342  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1536  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  32 
 
 
382 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0998383  hitchhiker  0.00855528 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01622  hypothetical protein  32 
 
 
327 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2374  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  32 
 
 
382 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.049386  normal  0.0849585 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  30.43 
 
 
284 aa  47.4  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  27 
 
 
209 aa  47.4  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1467  methyltransferase small  28.47 
 
 
207 aa  47.4  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000184007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0786  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.67 
 
 
406 aa  47.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0668711  normal  0.244469 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0443  methyltransferase type 12  39.44 
 
 
208 aa  47  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  29.13 
 
 
269 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  32.43 
 
 
267 aa  47  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  28.7 
 
 
414 aa  46.6  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1465  methyltransferase small  29.5 
 
 
204 aa  46.6  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0738691  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1786  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  31 
 
 
382 aa  46.6  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0118035 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3461  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31 
 
 
407 aa  46.6  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.248427  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1859  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  31 
 
 
382 aa  46.2  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286761  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0008  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.67 
 
 
199 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257422  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  27.78 
 
 
274 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0234  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.14 
 
 
420 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.950577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2111  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
224 aa  46.2  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1608  tellurite resistance protein TehB  28.44 
 
 
197 aa  45.8  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  26.09 
 
 
234 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  28.57 
 
 
234 aa  45.8  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07280  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  29.32 
 
 
211 aa  45.8  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.385173  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  26.83 
 
 
243 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1560  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  30 
 
 
382 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138047  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1523  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  30 
 
 
382 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1747  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  30 
 
 
382 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00423906  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1916  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  30 
 
 
382 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0810656  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2035  tellurite resistance protein TehB  28.44 
 
 
197 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211796  hitchhiker  1.4996099999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  25 
 
 
249 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2040  Methyltransferase type 12  32.39 
 
 
441 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>