185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2149 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  455  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6845  Methyltransferase type 12  57.87 
 
 
240 aa  271  5.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613911  normal  0.262077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5330  Methyltransferase type 12  56.5 
 
 
221 aa  259  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3655  SAM binding protein  56.54 
 
 
221 aa  252  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0969  methyltransferase type 12  55.56 
 
 
232 aa  246  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.71453 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2164  methyltransferase type 12  54.21 
 
 
232 aa  240  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00394597  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0912  Methyltransferase type 12  55.14 
 
 
224 aa  236  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.734519 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3121  methyltransferase type 12  52.36 
 
 
223 aa  223  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3337  methyltransferase type 12  54.26 
 
 
228 aa  219  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4362  methyltransferase type 12  39.91 
 
 
240 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0229  hypothetical protein  31.07 
 
 
236 aa  111  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3501  methyltransferase type 12  29.57 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  32.44 
 
 
228 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3745  methyltransferase type 11  36.4 
 
 
236 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195128  normal  0.0952192 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5571  methyltransferase type 11  35.96 
 
 
236 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134316  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1467  putative methyltransferase superfamily  28.7 
 
 
229 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000625282 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4516  methyltransferase type 11  35.45 
 
 
235 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178821  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3848  methyltransferase type 11  35.45 
 
 
235 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3679  methyltransferase type 11  35.45 
 
 
235 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321356  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2248  hypothetical protein  35.09 
 
 
266 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2078  methyltransferase type 12  34.24 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1654  methyltransferase type 11  29.2 
 
 
236 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190237  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2034  methyltransferase type 11  31.86 
 
 
228 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0142527  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2578  SAM-dependent methyltransferases  33.33 
 
 
237 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2442  hypothetical protein  33.64 
 
 
237 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3787  hypothetical protein  28.91 
 
 
237 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206629  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2050  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.73 
 
 
231 aa  89.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0880  hypothetical protein  33.18 
 
 
237 aa  89  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.480713  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0581  hypothetical protein  31.58 
 
 
237 aa  88.6  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4897  methyltransferase type 11  32.47 
 
 
234 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107852  hitchhiker  0.000103061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1013  Methyltransferase type 12  24.67 
 
 
234 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.178018 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3652  hypothetical protein  28.89 
 
 
243 aa  85.9  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282705  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38210  hypothetical protein  27.98 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000336854 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3708  methyltransferase type 12  28.78 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.434714  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3251  hypothetical protein  28.89 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  23.94 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2488  methyltransferase type 12  32.29 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.363231  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  20.64 
 
 
234 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1013  putative methyltransferase  21.2 
 
 
234 aa  62.4  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.500806  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  21.1 
 
 
234 aa  62.4  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  19.72 
 
 
234 aa  62  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  23.01 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1449  hypothetical protein  23.22 
 
 
226 aa  59.7  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2168  methyltransferase  25.93 
 
 
247 aa  58.5  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.869194  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  20.81 
 
 
235 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1524  methyltransferase domain-containing protein  20.93 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000120527  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2265  methyltransferase  23.98 
 
 
247 aa  57  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4095  methyltransferase type 12  30.51 
 
 
244 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1853  methyltransferase  23.79 
 
 
245 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.473649 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  25.86 
 
 
223 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  32.22 
 
 
225 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4027  putative methyltransferase  23.42 
 
 
243 aa  55.8  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  22.77 
 
 
270 aa  55.5  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  19.91 
 
 
235 aa  55.1  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1222  SAM-dependent methyltransferase  22.58 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.100139  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2395  methyltransferase  25.33 
 
 
258 aa  54.3  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1403  methyltransferase  24.45 
 
 
270 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.133547  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2818  methyltransferase  24.56 
 
 
260 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  27.53 
 
 
238 aa  53.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0079  methyltransferase  22.71 
 
 
251 aa  53.1  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  27.97 
 
 
242 aa  53.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  28.89 
 
 
287 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1672  methyltransferase type 12  29.81 
 
 
258 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.64 
 
 
223 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0618  methyltransferase, putative  19.91 
 
 
235 aa  52.8  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161711  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  32.61 
 
 
214 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2762  putative methyltransferase  22.91 
 
 
250 aa  52.8  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02156  putative methyltransferase  21.72 
 
 
243 aa  52.4  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0725617  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2112  putative methyltransferase  22.07 
 
 
244 aa  52  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.11 
 
 
215 aa  52  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  29.09 
 
 
200 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1562  putative methyltransferase  20.18 
 
 
234 aa  51.6  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.17303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  28.32 
 
 
355 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  25.71 
 
 
235 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1845  methyltransferase, putative  23.45 
 
 
243 aa  51.2  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.699945  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1465  SAM-dependent methyltransferase  30.92 
 
 
152 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1662  hypothetical protein  30.92 
 
 
152 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516086  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  27.56 
 
 
199 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  26.53 
 
 
363 aa  49.7  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2026  putative methyltransferase  21.92 
 
 
234 aa  50.1  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0148252  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  21.76 
 
 
258 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4582  methyltransferase  24.89 
 
 
247 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4212  methyltransferase, putative  23.68 
 
 
247 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0081  SAM-dependent methyltransferase  23.11 
 
 
245 aa  48.5  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000550828  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  31.62 
 
 
192 aa  48.5  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1897  Methyltransferase regulatory domain, predicted  31.36 
 
 
564 aa  48.5  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2592  hypothetical protein  25.96 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  26.47 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  30.6 
 
 
200 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  32.74 
 
 
246 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2880  methyltransferase  24.02 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000271391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1845  methyltransferase type 11  32.03 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2311  methyltransferase, putative  22.42 
 
 
288 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1720  O-methyltransferase family protein  32.28 
 
 
364 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.365884 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1811  methyltransferase  22.97 
 
 
261 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1482  putative methyltransferase  24.56 
 
 
247 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142219  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0698  putative methyltransferase  21.4 
 
 
242 aa  46.6  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2563  Methyltransferase type 12  23.08 
 
 
250 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.415136 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3550  Methyltransferase type 12  23.08 
 
 
250 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  28.21 
 
 
202 aa  46.2  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>