164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2592 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2592  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  440  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0315  hypothetical protein  55.45 
 
 
223 aa  240  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0042  Methyltransferase type 12  55.05 
 
 
223 aa  226  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0120  Methyltransferase type 12  55.5 
 
 
224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1655  methyltransferase type 12  47.73 
 
 
222 aa  194  8.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.159478  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  37.84 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1278  hypothetical protein  38.26 
 
 
226 aa  137  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14181  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.3 
 
 
226 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07191  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.86 
 
 
227 aa  121  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.0203679 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0094  SAM-dependent methyltransferase  31.86 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.333279  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0895  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.86 
 
 
220 aa  119  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195725 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07721  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.77 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000795739 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2907  Methyltransferase type 11  32.22 
 
 
240 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07171  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.97 
 
 
231 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07151  methylase  27.04 
 
 
235 aa  89  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.353179  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07351  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  23.81 
 
 
231 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.138217  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0662  hypothetical protein  26.41 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  31.46 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  33.02 
 
 
213 aa  59.3  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.14 
 
 
269 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
411 aa  53.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0705  Methyltransferase type 11  27.73 
 
 
300 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 
312 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  30.33 
 
 
229 aa  52  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0912  Methyltransferase type 12  31.91 
 
 
224 aa  52  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.734519 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  34.01 
 
 
253 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  37.98 
 
 
307 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  36.97 
 
 
307 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  36.29 
 
 
270 aa  50.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 
187 aa  49.7  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  26.03 
 
 
235 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  29.52 
 
 
240 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  24.56 
 
 
283 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
309 aa  49.7  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5944  methyltransferase type 12  29.93 
 
 
320 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199024  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3913  Methyltransferase type 12  32.09 
 
 
258 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00040245  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  26.54 
 
 
263 aa  48.5  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6845  Methyltransferase type 12  28.19 
 
 
240 aa  48.5  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613911  normal  0.262077 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.02 
 
 
268 aa  48.5  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5006  predicted protein  27.11 
 
 
270 aa  48.5  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0895863  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  25.96 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  33.95 
 
 
267 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  33.02 
 
 
353 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  26.29 
 
 
311 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1696  hypothetical protein  29.6 
 
 
231 aa  47  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  36.44 
 
 
264 aa  47  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0474  methyltransferase type 11  28.05 
 
 
217 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00410704  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 
272 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  28.65 
 
 
362 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  26.03 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.74 
 
 
245 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  25.17 
 
 
261 aa  47  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  29.37 
 
 
341 aa  46.2  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
363 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1748  hypothetical protein  33.06 
 
 
247 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.245631 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.06 
 
 
215 aa  46.2  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2020  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.14 
 
 
236 aa  46.2  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  23.93 
 
 
246 aa  46.2  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  29.57 
 
 
280 aa  46.2  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  27.68 
 
 
256 aa  45.8  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  32.03 
 
 
310 aa  45.8  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0229  hypothetical protein  26.29 
 
 
236 aa  45.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  30.09 
 
 
239 aa  45.4  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  30.91 
 
 
352 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  23.88 
 
 
269 aa  45.4  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  33.59 
 
 
246 aa  45.4  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  38.14 
 
 
216 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2164  methyltransferase type 12  40.48 
 
 
232 aa  45.1  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00394597  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  23.67 
 
 
305 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0061  Orf34  33.11 
 
 
246 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7265  MerR family transcriptional regulator  25.95 
 
 
391 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  29.5 
 
 
265 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1468  methyltransferase type 11  29.24 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.197661  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1325  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.44 
 
 
300 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0472952  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  28.65 
 
 
236 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1562  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.11 
 
 
246 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1474  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.11 
 
 
246 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0302671  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  27.96 
 
 
305 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  38.6 
 
 
230 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3335  Methyltransferase type 12  32.38 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.15309  unclonable  0.0000000176588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  30.48 
 
 
416 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  23.67 
 
 
305 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3130  hypothetical protein  28.3 
 
 
305 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  28.83 
 
 
202 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.19 
 
 
269 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1634  hypothetical protein  31.36 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1910  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.86 
 
 
420 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  31.25 
 
 
268 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1275  putative methyltransferase  28.7 
 
 
234 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 
265 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14451  SAM-dependent methyltransferase  30.77 
 
 
223 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  35.59 
 
 
358 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1778  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.94 
 
 
265 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525506  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  25.28 
 
 
197 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  26.42 
 
 
358 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.68 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3054  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.67 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  29.84 
 
 
271 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.8 
 
 
283 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.68 
 
 
256 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>