113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0229 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007410  Ava_B0229  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  492  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2078  methyltransferase type 12  38.32 
 
 
218 aa  153  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4362  methyltransferase type 12  37.38 
 
 
240 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1013  Methyltransferase type 12  34.2 
 
 
234 aa  138  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.178018 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1467  putative methyltransferase superfamily  33.78 
 
 
229 aa  134  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000625282 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3501  methyltransferase type 12  34.08 
 
 
229 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2164  methyltransferase type 12  34.4 
 
 
232 aa  128  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00394597  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5330  Methyltransferase type 12  35.92 
 
 
221 aa  126  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3708  methyltransferase type 12  34.43 
 
 
234 aa  124  9e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.434714  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4897  methyltransferase type 11  33.18 
 
 
234 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107852  hitchhiker  0.000103061 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2442  hypothetical protein  33.88 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0969  methyltransferase type 12  34.47 
 
 
232 aa  119  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.71453 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0880  hypothetical protein  33.47 
 
 
237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.480713  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3745  methyltransferase type 11  33.93 
 
 
236 aa  118  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195128  normal  0.0952192 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0581  hypothetical protein  33.48 
 
 
237 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2578  SAM-dependent methyltransferases  33.47 
 
 
237 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5571  methyltransferase type 11  33.48 
 
 
236 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134316  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6845  Methyltransferase type 12  32.68 
 
 
240 aa  116  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613911  normal  0.262077 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3655  SAM binding protein  32.68 
 
 
221 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2248  hypothetical protein  32.59 
 
 
266 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2488  methyltransferase type 12  34.93 
 
 
238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.363231  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38210  hypothetical protein  35.45 
 
 
224 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000336854 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3337  methyltransferase type 12  31.86 
 
 
228 aa  112  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  31.07 
 
 
223 aa  111  9e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4516  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178821  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3848  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1654  methyltransferase type 11  29.67 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190237  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3679  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321356  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0912  Methyltransferase type 12  31.22 
 
 
224 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.734519 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3251  hypothetical protein  37.04 
 
 
224 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3121  methyltransferase type 12  34.12 
 
 
223 aa  105  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3652  hypothetical protein  31.96 
 
 
243 aa  102  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282705  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4095  methyltransferase type 12  34.21 
 
 
244 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  29.06 
 
 
228 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3787  hypothetical protein  28.14 
 
 
237 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206629  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2050  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  25.96 
 
 
231 aa  90.1  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1465  SAM-dependent methyltransferase  35.67 
 
 
152 aa  85.5  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1662  hypothetical protein  35.67 
 
 
152 aa  85.5  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516086  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2034  methyltransferase type 11  28.28 
 
 
228 aa  82  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0142527  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  28.64 
 
 
249 aa  55.5  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  32.67 
 
 
335 aa  55.1  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19651  hypothetical protein  22.12 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0644174 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  23.56 
 
 
223 aa  52  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  27.7 
 
 
289 aa  52  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  32.69 
 
 
629 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4039  methyltransferase type 12  30.57 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3896  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
208 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.744662  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.32 
 
 
269 aa  49.7  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 
218 aa  49.3  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1055  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  26.45 
 
 
218 aa  49.3  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.265378 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0604  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.3 
 
 
212 aa  48.5  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.977459  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
327 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  35.78 
 
 
213 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2189  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  25.83 
 
 
229 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
339 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  26.76 
 
 
242 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0696  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.12 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 
305 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  28.41 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  32.08 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2592  hypothetical protein  26.29 
 
 
220 aa  45.4  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3364  hypothetical protein  28 
 
 
201 aa  45.4  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  32.43 
 
 
353 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.06 
 
 
223 aa  45.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  30.66 
 
 
330 aa  45.4  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  28.81 
 
 
328 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  34.55 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  28.49 
 
 
270 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02156  putative methyltransferase  24.54 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0725617  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.77 
 
 
244 aa  45.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  27.78 
 
 
213 aa  44.3  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2195  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  33.94 
 
 
213 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  30.16 
 
 
4483 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 
254 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2021  Methyltransferase type 11  26.85 
 
 
268 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2086  hypothetical protein  27.27 
 
 
207 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
215 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0703  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  30 
 
 
221 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161122  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3068  Methyltransferase type 12  27.43 
 
 
288 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
337 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2544  methyltransferase type 12  30.51 
 
 
200 aa  43.5  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  30 
 
 
209 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 
209 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3154  hypothetical protein  30 
 
 
221 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  27.27 
 
 
267 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  22.11 
 
 
360 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  25.34 
 
 
228 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0124  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30 
 
 
221 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.528868  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1464  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30 
 
 
221 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0519  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30 
 
 
221 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0537  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30 
 
 
221 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2892  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30 
 
 
221 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 
254 aa  43.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2097  hypothetical protein  27.27 
 
 
207 aa  42.7  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1430  modification methylase, HemK family  28.42 
 
 
273 aa  42.7  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000467016  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3054  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.78 
 
 
236 aa  42.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41460  Modification methylase HemK  31.82 
 
 
276 aa  42.7  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1999  2-heptaprenyl-1,4- naphthoquinonemethyltransferas e  30.48 
 
 
235 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.753273  normal  0.375757 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
246 aa  42.4  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  30.22 
 
 
336 aa  42.4  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>