More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2012 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  100 
 
 
263 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  51.35 
 
 
263 aa  270  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  50.78 
 
 
268 aa  260  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  46.74 
 
 
263 aa  257  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  46.74 
 
 
263 aa  257  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  46.74 
 
 
263 aa  257  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  45.95 
 
 
258 aa  256  3e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  38.56 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  35.57 
 
 
258 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  31.51 
 
 
264 aa  122  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  28.98 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1261  hypothetical protein  31.06 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  29.89 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  28.74 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  35.41 
 
 
254 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.98 
 
 
264 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  33.81 
 
 
337 aa  105  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 
247 aa  105  7e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  28.52 
 
 
252 aa  102  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  31.9 
 
 
258 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  28.88 
 
 
255 aa  99.4  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  29.51 
 
 
255 aa  99  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  26.22 
 
 
258 aa  99  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  29.28 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.57 
 
 
254 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  31.63 
 
 
262 aa  96.7  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  30.09 
 
 
263 aa  95.5  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.79 
 
 
257 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  29.44 
 
 
246 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  30.77 
 
 
251 aa  94.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 
259 aa  94  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2149  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 
260 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.77 
 
 
254 aa  89.7  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  28.06 
 
 
258 aa  89.4  6e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.76 
 
 
259 aa  89.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.43 
 
 
253 aa  89  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  30.81 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  31.6 
 
 
258 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3158  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.46 
 
 
252 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.56 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.81 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  24.81 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  25 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  25 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.81 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  24.81 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.91 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1601  trans-aconitate 2-methyltransferase  25 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.767111  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.99 
 
 
268 aa  82  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0316  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.86 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.224637  normal  0.898974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.46 
 
 
268 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.25 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.52 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  24.59 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0992  Trans-aconitate 2-methyltransferase  25.59 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01566  conserved hypothetical protein  28.63 
 
 
279 aa  79  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145995  normal  0.121317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.49 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  24.33 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.41 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.7 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0334  hypothetical protein  35.88 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.92 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0277  methyltransferase type 11  28.07 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.51 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.19 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  29.07 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.68 
 
 
287 aa  75.5  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0374  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.1 
 
 
254 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603842  normal  0.758289 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  22.31 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0386  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.1 
 
 
254 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0397352  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  29.57 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0395  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.1 
 
 
254 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0358  hypothetical protein  37.31 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  28.57 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.85 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  38.53 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  21.97 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  21.97 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  21.97 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0425  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.82 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.500195  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  25.91 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  25.11 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2620  hypothetical protein  27.95 
 
 
266 aa  72  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2747  hypothetical protein  27.95 
 
 
266 aa  72  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.37 
 
 
256 aa  72  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  21.9 
 
 
258 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1455  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.57 
 
 
255 aa  72  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  25.53 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1410  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.57 
 
 
255 aa  72  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  24.35 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.15 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.35 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.41 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13820  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.3 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0581  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.17 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2216  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.37 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414358  normal  0.438361 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2018  trans-aconitate 2-methyltransferase  22.48 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00947857  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  22.43 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  30.88 
 
 
415 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>