More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1261 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1261  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  519  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  46.47 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  43.32 
 
 
252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2149  Methyltransferase type 11  43.92 
 
 
260 aa  191  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  42.4 
 
 
268 aa  187  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  41.37 
 
 
260 aa  186  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  42 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  37.9 
 
 
252 aa  174  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  39.2 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  40.4 
 
 
258 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  41.04 
 
 
251 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  41.04 
 
 
262 aa  168  8e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  36.61 
 
 
259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  37.4 
 
 
251 aa  163  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  39.83 
 
 
337 aa  162  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  33.47 
 
 
253 aa  150  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  33.87 
 
 
247 aa  144  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  33.86 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  32.95 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01566  conserved hypothetical protein  33.07 
 
 
279 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145995  normal  0.121317 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  28.14 
 
 
263 aa  119  6e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  28.14 
 
 
263 aa  119  6e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  28.14 
 
 
263 aa  119  6e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00200  conserved hypothetical protein  32.13 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  30.53 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  29.62 
 
 
268 aa  113  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  28.29 
 
 
258 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 
255 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  28.14 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.13 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  26.78 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  24.16 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0277  methyltransferase type 11  25.81 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.18 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  32.22 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.82 
 
 
254 aa  62.8  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.82 
 
 
254 aa  62.4  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  29.28 
 
 
244 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.13 
 
 
287 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.1 
 
 
255 aa  60.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  33.7 
 
 
248 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01594  methyltransferase  28.14 
 
 
323 aa  59.3  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.62 
 
 
230 aa  59.3  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  32.81 
 
 
282 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0656  hypothetical protein  26.37 
 
 
243 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0241729  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  35.29 
 
 
243 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003929  tRNA (5-methoxyuridine) 34 synthase  27.54 
 
 
323 aa  58.5  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00210133  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1884  putative methyltransferase  29.34 
 
 
324 aa  58.5  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  23.84 
 
 
269 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  36.63 
 
 
265 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  33.78 
 
 
262 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  23.84 
 
 
269 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4681  hypothetical protein  25.97 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740312  hitchhiker  1.6173199999999999e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  23.44 
 
 
269 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  23.44 
 
 
269 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  23.44 
 
 
269 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  23.44 
 
 
269 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  23.44 
 
 
269 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1297  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.53 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.37 
 
 
253 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.48 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13820  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.87 
 
 
255 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  31.52 
 
 
220 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  31.52 
 
 
220 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  31.52 
 
 
220 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  30.77 
 
 
268 aa  56.2  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  31.52 
 
 
220 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 
257 aa  56.2  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  31.52 
 
 
220 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  31.52 
 
 
220 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  28.44 
 
 
248 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  28.44 
 
 
248 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  31.52 
 
 
220 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 
1314 aa  56.2  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.35 
 
 
207 aa  55.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  33.93 
 
 
269 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0697  putative methyltransferase  29.27 
 
 
328 aa  55.8  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
415 aa  55.5  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
252 aa  55.8  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.77 
 
 
250 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  27.93 
 
 
255 aa  55.5  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.66 
 
 
236 aa  55.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.25 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  23.68 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  30.83 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  38.61 
 
 
220 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  33.08 
 
 
212 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  31.37 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.88 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.46 
 
 
325 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 
270 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  35.79 
 
 
244 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4330  methyltransferase type 11  27.52 
 
 
248 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.510233  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  28.99 
 
 
238 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>