More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1318 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
1314 aa  2685    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  61.82 
 
 
1287 aa  1522    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  59.59 
 
 
1312 aa  1476    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  35.04 
 
 
1256 aa  606  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0044  glycosyl transferase family protein  45.52 
 
 
746 aa  594  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  44.5 
 
 
1444 aa  531  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  42.45 
 
 
1185 aa  486  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  38.79 
 
 
1317 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  39.07 
 
 
814 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  39.4 
 
 
1673 aa  366  2e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  37.93 
 
 
987 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  37.58 
 
 
1035 aa  335  3e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  37 
 
 
1059 aa  332  3e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  37.64 
 
 
995 aa  316  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  35.41 
 
 
1313 aa  310  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  33.92 
 
 
1322 aa  303  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2886  glycosyl transferase family 2  34.92 
 
 
1008 aa  249  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0431865 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1895  glycosyl transferase family protein  41.92 
 
 
953 aa  244  7.999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207282  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1793  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.13 
 
 
862 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0930  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
827 aa  234  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0478435 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  40.07 
 
 
723 aa  234  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1402  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
852 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4121  glycosyl transferase family protein  32.7 
 
 
850 aa  225  4.9999999999999996e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276059  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0549  glycosyl transferase family protein  35.24 
 
 
818 aa  189  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567321  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1063  glycosyl transferase family protein  39.61 
 
 
818 aa  189  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  35.11 
 
 
597 aa  184  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 
1600 aa  145  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1126  Methyltransferase type 11  39.39 
 
 
229 aa  125  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 
680 aa  121  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
996 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  26.23 
 
 
746 aa  117  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 
1523 aa  117  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4464  Methyltransferase type 12  25.05 
 
 
543 aa  116  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  31.56 
 
 
1523 aa  115  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 
1162 aa  114  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3087  hypothetical protein  25 
 
 
353 aa  108  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123974  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  29.28 
 
 
1119 aa  108  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 
1268 aa  107  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  28.25 
 
 
1435 aa  106  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1835  methyltransferase type 12  35.71 
 
 
231 aa  105  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
369 aa  105  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  33.54 
 
 
229 aa  103  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  33.54 
 
 
229 aa  103  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  33.54 
 
 
229 aa  102  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  34.15 
 
 
229 aa  102  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  33.54 
 
 
229 aa  102  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  34.15 
 
 
229 aa  101  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  32.93 
 
 
229 aa  101  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  32.93 
 
 
229 aa  101  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  32.93 
 
 
229 aa  101  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  32.93 
 
 
229 aa  101  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
457 aa  98.2  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
624 aa  97.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  28.73 
 
 
785 aa  95.9  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 
679 aa  95.1  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2011  hypothetical protein  33.94 
 
 
199 aa  93.2  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.714234 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1345  hypothetical protein  38.46 
 
 
231 aa  93.2  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  35.67 
 
 
217 aa  92  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  30.49 
 
 
228 aa  91.3  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0312  hypothetical protein  40.51 
 
 
216 aa  90.5  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.121352 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05411  putative glycosyl transferase  31.11 
 
 
387 aa  88.2  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42422  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3006  methyltransferase type 12  30.87 
 
 
681 aa  87.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633739  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 
1340 aa  86.7  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  30.77 
 
 
215 aa  85.9  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 
303 aa  84  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1695  methyltransferase type 11  34.93 
 
 
211 aa  84  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0925048  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 
1739 aa  84  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0259  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
658 aa  83.2  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  36.3 
 
 
249 aa  82.8  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  31.27 
 
 
616 aa  82.8  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  36.77 
 
 
581 aa  82  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  36.99 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  26.69 
 
 
2401 aa  81.6  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4317  hypothetical protein  28.94 
 
 
489 aa  81.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0432  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
348 aa  80.5  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0278  glycosyl transferase family 2  22.41 
 
 
576 aa  79.7  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.859999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2592  methyltransferase type 11  31.34 
 
 
219 aa  79.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
300 aa  79.3  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 
361 aa  78.6  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  29 
 
 
280 aa  76.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0661  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
222 aa  75.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.259712  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
270 aa  75.5  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0639  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
222 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 
308 aa  74.3  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2476  methyltransferase type 12  35.25 
 
 
229 aa  74.3  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02687  hypothetical protein  27.11 
 
 
279 aa  73.6  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.475562  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 
301 aa  73.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
970 aa  73.6  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0060  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
656 aa  73.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19162  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
994 aa  73.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 
635 aa  73.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 
355 aa  73.6  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  26.86 
 
 
860 aa  72.4  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0299  methionine biosynthesis protein MetW  28.21 
 
 
247 aa  72  0.00000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.974388  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2557  glycosyl transferase family protein  23.5 
 
 
499 aa  72  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  24.74 
 
 
325 aa  70.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 
305 aa  70.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
334 aa  70.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0885  glycosyl transferase family 2  28.75 
 
 
817 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  28.05 
 
 
353 aa  70.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>