More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13375 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  100 
 
 
243 aa  482  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  80.59 
 
 
239 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  79.75 
 
 
239 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  79.75 
 
 
239 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  78.75 
 
 
242 aa  378  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  77.64 
 
 
246 aa  377  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  50.21 
 
 
256 aa  202  4e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  50.88 
 
 
247 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  50.21 
 
 
245 aa  195  6e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  45.04 
 
 
252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  49.55 
 
 
243 aa  180  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  44.17 
 
 
275 aa  174  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  41.7 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  42.39 
 
 
254 aa  168  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  41.46 
 
 
257 aa  168  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  40.08 
 
 
257 aa  165  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  39.68 
 
 
255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  38.55 
 
 
263 aa  152  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  42.15 
 
 
271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  40.68 
 
 
255 aa  148  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  40.82 
 
 
260 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  39.92 
 
 
256 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  38.06 
 
 
255 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  41.35 
 
 
270 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  36.44 
 
 
255 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  38.53 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  40 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.03 
 
 
308 aa  126  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  37.75 
 
 
251 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.4 
 
 
280 aa  105  6e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  37.75 
 
 
251 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  37.09 
 
 
251 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  36.42 
 
 
251 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  36.42 
 
 
251 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  36.42 
 
 
251 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  35.76 
 
 
251 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4001  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 
248 aa  97.8  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 
249 aa  97.1  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
256 aa  95.5  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.89 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  33.04 
 
 
263 aa  87.8  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  31.47 
 
 
257 aa  87  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86084  methyltransferase  31.17 
 
 
333 aa  87.4  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0255585 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  37.97 
 
 
242 aa  87  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  42.11 
 
 
261 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  39.1 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 
277 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  27.18 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 
252 aa  77  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1419  putative methyltransferase  30.66 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.412346  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1753  putative methyltransferase  30.66 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.148038  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  35.56 
 
 
254 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  32.59 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  35.04 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5557  Methyltransferase type 12  30.08 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  37.5 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29451  hypothetical protein  27.27 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  30.8 
 
 
273 aa  72  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2889  methyltransferase type 11  35.85 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000212071 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  36.8 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2382  Methyltransferase type 11  36.09 
 
 
495 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571429  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  39.8 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1418  putative methyltransferase  32.79 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.282901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  35.96 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  29.63 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0734  Methyltransferase type 11  29.39 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.599547  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4330  methyltransferase type 11  42.27 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.510233  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  29.21 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  32.59 
 
 
268 aa  68.6  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  36.49 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0312  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.763248  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  28.64 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 
268 aa  67  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  34.65 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  33.33 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  39.47 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  41.75 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  36.81 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  33.53 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3652  Methyltransferase type 11  34.85 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3953  methyltransferase type 11  38.24 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1525  methyltransferase type 11  36.73 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
457 aa  65.9  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0313  putative methyltransferase  33.33 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.459942  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  43 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0272  methyltransferase type 11  43.33 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5296  Methyltransferase type 11  27.02 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  35.43 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1629  hypothetical protein  32 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.93 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  38.71 
 
 
256 aa  65.1  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 
337 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1752  putative methyltransferase  31.15 
 
 
253 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.610135  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  38.17 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>