More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4140 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  100 
 
 		 255 aa  521  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  73.23 
 
 		 255 aa  367  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  65.61 
 
 		 255 aa  349  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  64.03 
 
 		 255 aa  341  9e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  58.5 
 
 		 259 aa  314  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  56.92 
 
 		 260 aa  287  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  53.78 
 
 		 257 aa  285  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  58.82 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  43.78 
 
 		 246 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  42.74 
 
 		 242 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  43.22 
 
 		 239 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  43.22 
 
 		 239 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  43.21 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  40.24 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  39.68 
 
 		 243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  40.16 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  39.84 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  46.23 
 
 		 245 aa  142  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  38.27 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  41.28 
 
 		 259 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  41.88 
 
 		 270 aa  138  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  41.53 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  48.65 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  51.7 
 
 		 271 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  48.98 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  39.07 
 
 		 251 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  39.07 
 
 		 251 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  39.07 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  39.07 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  38.41 
 
 		 251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  38.41 
 
 		 251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  43.07 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  32.27 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  39.74 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  41.22 
 
 		 242 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  40.24 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  41.04 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86084  methyltransferase  23.89 
 
 		 333 aa  102  7e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0255585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.57 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  45.45 
 
 		 280 aa  92  8e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03990  expressed protein  26.09 
 
 		 364 aa  90.1  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.43 
 
 		 308 aa  89.4  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  34.21 
 
 		 263 aa  89  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  36.65 
 
 		 261 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  41.89 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  42.19 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0455  methyltransferase type 11  50 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  40.58 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  33.92 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  36.8 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3652  Methyltransferase type 11  36.09 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3369  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.209889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2733  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  34.16 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.01 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  38.71 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  39.84 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1753  putative methyltransferase  29.79 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.148038  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  41.98 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  37.21 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  41.13 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1419  putative methyltransferase  29.79 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.412346  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4070  MerR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.354959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3007  methyltransferase type 11  38.57 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036599  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  29.66 
 
 		 278 aa  72  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  40.32 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0410  Methyltransferase type 11  33.81 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.371089 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  44.44 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 457 aa  69.7  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1629  hypothetical protein  35.35 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5557  Methyltransferase type 12  35.88 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  36.64 
 
 		 268 aa  68.6  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3133  Methyltransferase type 11  34.96 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  40 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  27.69 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0132  Methyltransferase type 11  38.58 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4328  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  40 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  37.12 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4278  Methyltransferase type 11  40.78 
 
 		 186 aa  67  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.867588  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  39.64 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5511  methyltransferase  30.41 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.139687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  33.33 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  36.22 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  34.09 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  40.43 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>