More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3885 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  100 
 
 
274 aa  560  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  40.91 
 
 
270 aa  194  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  38.49 
 
 
269 aa  178  9e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  38.02 
 
 
274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  34.72 
 
 
269 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.06 
 
 
273 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4839  putative methyltransferase  33.58 
 
 
271 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  35.23 
 
 
273 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  35.04 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  25.79 
 
 
275 aa  85.5  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0896  Methyltransferase type 11  37.41 
 
 
350 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 
262 aa  75.5  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  37.1 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  32.03 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  29.13 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  29.13 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  29.13 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  34.46 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 
350 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  27.13 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  39.29 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1915  methyltransferase type 11  31.94 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0565033  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.11 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  31.11 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  23.66 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  23.66 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  23.66 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  29.21 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.59 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  40.71 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  25.19 
 
 
415 aa  68.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.11 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
211 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.81 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.11 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  31.72 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  38.83 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  25.5 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  33.33 
 
 
258 aa  67  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  38.38 
 
 
246 aa  67  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  31.54 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  29.68 
 
 
268 aa  67  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  37.29 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  41.44 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  37.14 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  29.03 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  37.38 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  35.11 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  33.03 
 
 
269 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.1 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 
237 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.5 
 
 
277 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
252 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.04 
 
 
205 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00200  conserved hypothetical protein  26.45 
 
 
276 aa  63.9  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  24.76 
 
 
243 aa  63.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.09 
 
 
271 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.09 
 
 
241 aa  63.5  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2682  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 
262 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  32.79 
 
 
216 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.09 
 
 
241 aa  63.5  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
263 aa  63.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  29.71 
 
 
249 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  34.96 
 
 
201 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.36 
 
 
280 aa  63.2  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6864  Methyltransferase type 11  33.81 
 
 
307 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  27.08 
 
 
242 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0084  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
235 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.5 
 
 
260 aa  62.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.15 
 
 
346 aa  63.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  27.75 
 
 
246 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 
252 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  36.61 
 
 
255 aa  63.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0094  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
235 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0103  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
235 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 
265 aa  62.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  24.87 
 
 
286 aa  62.4  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  29.47 
 
 
215 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  29.77 
 
 
254 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  29.14 
 
 
284 aa  62.4  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3620  hypothetical protein  30.43 
 
 
346 aa  62  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.615774  normal  0.159076 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  33.58 
 
 
273 aa  62  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  38.94 
 
 
298 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  28.04 
 
 
269 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  33.03 
 
 
255 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2807  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 
228 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  28.49 
 
 
263 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  31.25 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.36 
 
 
277 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  32.64 
 
 
208 aa  62  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  22.76 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  30.6 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0786  hypothetical protein  32.65 
 
 
242 aa  60.8  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.27206  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.33 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  31.06 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>