More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3620 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3620  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  721    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.615774  normal  0.159076 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  59.3 
 
 		 355 aa  432  1e-120  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2318  methyltransferase type 11  59.76 
 
 		 349 aa  430  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399773  normal  0.0108051 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  56.9 
 
 		 346 aa  423  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3557  Methyltransferase type 11  56.42 
 
 		 369 aa  418  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2550  methyltransferase type 11  56.07 
 
 		 348 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00904798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  56.14 
 
 		 356 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39627  predicted protein  56.01 
 
 		 410 aa  399  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28006  predicted protein  48.48 
 
 		 418 aa  322  8e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.122244 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4641  UbiE/COQ5 methyltransferase  53.85 
 
 		 296 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  47.42 
 
 		 350 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0896  Methyltransferase type 11  46.2 
 
 		 350 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0301  methyltransferase type 11  31.31 
 
 		 380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  44.25 
 
 		 277 aa  138  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1418  methyltransferase type 11  27.85 
 
 		 379 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.685062  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  43.1 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  43.68 
 
 		 277 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0411  hypothetical protein  35.19 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0624483  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04771  putative methyltransferase  33.91 
 
 		 264 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1991  methyltransferase type 11  29.23 
 
 		 411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04351  putative methyltransferase  32.76 
 
 		 264 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04661  putative methyltransferase  32.76 
 
 		 264 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  34.45 
 
 		 262 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08531  putative methyltransferase  33.46 
 
 		 267 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4114  Methyltransferase type 11  28.09 
 
 		 365 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.199074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2227  Methyltransferase type 11  27.96 
 
 		 396 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 298 aa  126  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  44.32 
 
 		 272 aa  126  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04141  putative methyltransferase  33.33 
 
 		 241 aa  125  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4075  Methyltransferase type 11  28.09 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1984  methyltransferase-like  33.46 
 
 		 270 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0923  Methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 1039 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  36.48 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0677  methyltransferase-like  35.14 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 279 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.32 
 
 		 266 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 237 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.45 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.89 
 
 		 279 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 1002 aa  114  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  40.68 
 
 		 273 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  31.47 
 
 		 1005 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  40.56 
 
 		 248 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  32.16 
 
 		 1014 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  39.13 
 
 		 283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  41.42 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  39.43 
 
 		 265 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  41.76 
 
 		 276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2645  methyltransferase type 11  35.91 
 
 		 262 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 1000 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3607  Methyltransferase type 11  28.62 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.289928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.71 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1514  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.92 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.732855  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.17 
 
 		 270 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  37.43 
 
 		 263 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 267 aa  106  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  37.99 
 
 		 295 aa  105  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  33.68 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  32.02 
 
 		 281 aa  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1027  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 276 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 267 aa  99.4  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0104  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 260 aa  97.1  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3376  Methyltransferase type 11  38.82 
 
 		 256 aa  96.3  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0407493  hitchhiker  0.00438973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3308  methyltransferase type 11  35.36 
 
 		 239 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358181  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  34.03 
 
 		 262 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  33.48 
 
 		 265 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 274 aa  93.2  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3346  Methyltransferase type 11  36.47 
 
 		 265 aa  92.4  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408224  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1224  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 282 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.158383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3743  methyltransferase type 11  35.16 
 
 		 267 aa  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1196  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 259 aa  90.5  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1636  methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 261 aa  89.4  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.431948  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00700  conserved hypothetical protein  37.58 
 
 		 239 aa  89  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 411 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  33.97 
 
 		 409 aa  87.8  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 216 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  35.48 
 
 		 246 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0388  type 11 methyltransferase  26.32 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  35.81 
 
 		 209 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1914  Methyltransferase type 11  27.42 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04625  arsenic methyltransferase Cyt19, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G15020)  33.33 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3797  hypothetical protein  25.95 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2474  Methyltransferase type 11  28.43 
 
 		 226 aa  75.5  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  39.1 
 
 		 241 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  35.88 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  32.9 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_25654  predicted protein  39.39 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4839  putative methyltransferase  36.29 
 
 		 271 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05015  hypothetical protein  26.48 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3171  methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  27.19 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  27.94 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 		 269 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>