More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05015 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05015  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  669    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3797  hypothetical protein  54.35 
 
 		 350 aa  385  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0388  type 11 methyltransferase  54.04 
 
 		 322 aa  375  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1914  Methyltransferase type 11  53.8 
 
 		 324 aa  368  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  32.47 
 
 		 1014 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 1002 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  33.68 
 
 		 1000 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  31.23 
 
 		 1005 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2227  Methyltransferase type 11  28.29 
 
 		 396 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372982 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.67 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 262 aa  106  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0301  methyltransferase type 11  27.8 
 
 		 380 aa  105  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.58 
 
 		 266 aa  103  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.91 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4075  Methyltransferase type 11  26.04 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0896  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 350 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4114  Methyltransferase type 11  26.44 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.199074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.13 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1991  methyltransferase type 11  26.79 
 
 		 411 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.29 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1224  methyltransferase type 11  33.51 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.158383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  29.69 
 
 		 246 aa  94  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.67 
 
 		 277 aa  92.8  6e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  29.89 
 
 		 265 aa  92.8  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.11 
 
 		 270 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3607  Methyltransferase type 11  25.96 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.289928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  26.03 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0923  Methyltransferase type 11  26.48 
 
 		 1039 aa  91.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0677  methyltransferase-like  28.21 
 
 		 266 aa  90.9  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 263 aa  90.1  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  29.67 
 
 		 281 aa  89.4  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  28.37 
 
 		 263 aa  89.4  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3346  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408224  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.77 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.02 
 
 		 280 aa  87.4  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04771  putative methyltransferase  26.91 
 
 		 264 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1984  methyltransferase-like  28.45 
 
 		 270 aa  87  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.57 
 
 		 277 aa  86.7  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  26.44 
 
 		 268 aa  85.9  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.38 
 
 		 266 aa  85.9  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  26.54 
 
 		 350 aa  85.9  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 		 264 aa  85.9  9e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  29.89 
 
 		 237 aa  85.9  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  28.19 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.58 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  30.11 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08531  putative methyltransferase  25.85 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  25.11 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0411  hypothetical protein  25.51 
 
 		 264 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0624483  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  27.59 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  27.23 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3743  methyltransferase type 11  29.35 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  27.57 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3376  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0407493  hitchhiker  0.00438973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  25.71 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28006  predicted protein  23.94 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.122244 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04351  putative methyltransferase  25.1 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04661  putative methyltransferase  25.1 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1514  arsenite S-adenosylmethyltransferase  24.08 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.732855  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.61 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  29.19 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0104  Methyltransferase type 11  28.49 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1196  Methyltransferase type 11  26.27 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  26.84 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1418  methyltransferase type 11  24.02 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.685062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04141  putative methyltransferase  27.51 
 
 		 241 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2318  methyltransferase type 11  22.97 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399773  normal  0.0108051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  25.85 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1636  methyltransferase type 11  25.12 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.431948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.92 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39627  predicted protein  26.32 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00700  conserved hypothetical protein  25.7 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1027  Methyltransferase type 11  23.61 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  23.26 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  30.34 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2550  methyltransferase type 11  25.35 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00904798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2645  methyltransferase type 11  22.79 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  25.45 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 216 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04625  arsenic methyltransferase Cyt19, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G15020)  23.3 
 
 		 282 aa  67  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3557  Methyltransferase type 11  23.98 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  25.11 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3171  methyltransferase type 11  29.49 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3620  hypothetical protein  26.48 
 
 		 346 aa  65.9  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.615774  normal  0.159076 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  25.47 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  28.91 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.55 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.33 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2500  Methyltransferase type 11  25.81 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.97 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.97 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  34.11 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.63 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  36.13 
 
 		 239 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_25654  predicted protein  25.87 
 
 		 200 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.78 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>