More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0259 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  64.28 
 
 		 1002 aa  1356    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0923  Methyltransferase type 11  46.99 
 
 		 1039 aa  942    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  51.69 
 
 		 1014 aa  1080    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 1005 aa  2085    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  49.5 
 
 		 1000 aa  1020    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  41.22 
 
 		 727 aa  213  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4167  SAM-dependent methyltransferase  34.32 
 
 		 279 aa  170  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30219  normal  0.258943 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1930  SAM-dependent methyltransferases  34.35 
 
 		 278 aa  161  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.313552  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4114  Methyltransferase type 11  30.9 
 
 		 365 aa  157  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.199074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4075  Methyltransferase type 11  30.9 
 
 		 365 aa  157  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0301  methyltransferase type 11  31.84 
 
 		 380 aa  156  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2227  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 		 396 aa  155  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372982 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05240  hypothetical protein  35.27 
 
 		 230 aa  154  5.9999999999999996e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.894138 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1999  hypothetical protein  35.4 
 
 		 237 aa  153  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  41.54 
 
 		 266 aa  151  6e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0677  methyltransferase-like  37.24 
 
 		 266 aa  150  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3607  Methyltransferase type 11  33.2 
 
 		 307 aa  148  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.289928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  39.57 
 
 		 272 aa  146  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  40.09 
 
 		 265 aa  146  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2638  hypothetical protein  36.71 
 
 		 208 aa  145  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.642066  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1991  methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 411 aa  145  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04661  putative methyltransferase  35.15 
 
 		 264 aa  144  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08531  putative methyltransferase  35.56 
 
 		 267 aa  144  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  40.41 
 
 		 280 aa  143  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  39.34 
 
 		 248 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  40.93 
 
 		 350 aa  142  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1984  methyltransferase-like  36.18 
 
 		 270 aa  142  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04351  putative methyltransferase  34.73 
 
 		 264 aa  142  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  36.94 
 
 		 262 aa  140  8.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.86 
 
 		 277 aa  140  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0411  hypothetical protein  34.73 
 
 		 264 aa  139  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0624483  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.71 
 
 		 271 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  39.78 
 
 		 283 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 280 aa  138  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1514  arsenite S-adenosylmethyltransferase  45.18 
 
 		 280 aa  139  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.732855  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  42.2 
 
 		 298 aa  138  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.88 
 
 		 276 aa  138  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1418  methyltransferase type 11  30.26 
 
 		 379 aa  137  8e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.685062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  39.9 
 
 		 277 aa  137  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04141  putative methyltransferase  33.47 
 
 		 241 aa  136  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.64 
 
 		 266 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04771  putative methyltransferase  34.58 
 
 		 264 aa  135  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.71 
 
 		 356 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  40.96 
 
 		 263 aa  134  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 265 aa  133  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0896  Methyltransferase type 11  39.9 
 
 		 350 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.17 
 
 		 268 aa  132  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  40.38 
 
 		 281 aa  132  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.08 
 
 		 346 aa  132  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  35.47 
 
 		 279 aa  131  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  32.71 
 
 		 355 aa  130  9.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  40.48 
 
 		 263 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  40.64 
 
 		 246 aa  129  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3557  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 369 aa  129  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  41.3 
 
 		 295 aa  129  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1027  Methyltransferase type 11  37.56 
 
 		 258 aa  128  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.8 
 
 		 279 aa  128  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2645  methyltransferase type 11  36.06 
 
 		 262 aa  127  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 267 aa  127  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28006  predicted protein  34.93 
 
 		 418 aa  127  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.122244 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3743  methyltransferase type 11  41.01 
 
 		 267 aa  126  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39627  predicted protein  32.01 
 
 		 410 aa  125  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2318  methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 349 aa  125  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399773  normal  0.0108051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  38.3 
 
 		 274 aa  125  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1224  methyltransferase type 11  39.78 
 
 		 282 aa  124  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.158383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  37.78 
 
 		 276 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1636  methyltransferase type 11  37.23 
 
 		 261 aa  123  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.431948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  36.1 
 
 		 237 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  36.68 
 
 		 409 aa  121  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0104  Methyltransferase type 11  38.59 
 
 		 260 aa  121  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  36.17 
 
 		 262 aa  121  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0035  hypothetical protein  34.27 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 		 288 aa  120  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3376  Methyltransferase type 11  42.77 
 
 		 256 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0407493  hitchhiker  0.00438973 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  36.61 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1619  hypothetical protein  31.11 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 411 aa  119  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3346  Methyltransferase type 11  37.57 
 
 		 265 aa  118  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408224  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.33 
 
 		 270 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  42.38 
 
 		 273 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1196  Methyltransferase type 11  38.59 
 
 		 259 aa  116  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  39.76 
 
 		 264 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04625  arsenic methyltransferase Cyt19, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G15020)  34.64 
 
 		 282 aa  114  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3620  hypothetical protein  31.47 
 
 		 346 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.615774  normal  0.159076 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05015  hypothetical protein  31.23 
 
 		 322 aa  111  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2550  methyltransferase type 11  35.41 
 
 		 348 aa  111  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00904798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3308  methyltransferase type 11  34.87 
 
 		 239 aa  107  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358181  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  36.81 
 
 		 241 aa  107  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 		 355 aa  105  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00700  conserved hypothetical protein  35.23 
 
 		 239 aa  104  7e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 209 aa  104  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3260  SAM-dependent methyltransferase  31.02 
 
 		 245 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  28.29 
 
 		 565 aa  100  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3171  methyltransferase type 11  41.35 
 
 		 204 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 216 aa  98.2  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  26.84 
 
 		 380 aa  94  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1914  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 324 aa  93.2  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  25.87 
 
 		 380 aa  91.3  9e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  31.69 
 
 		 377 aa  90.1  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1991  radical SAM domain-containing protein  26.55 
 
 		 381 aa  89  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0387606  normal  0.206645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>