More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1612 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  100 
 
 		 356 aa  736    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  73.64 
 
 		 346 aa  543  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  72.06 
 
 		 355 aa  519  1e-146  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3557  Methyltransferase type 11  72.16 
 
 		 369 aa  497  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2318  methyltransferase type 11  66.77 
 
 		 349 aa  469  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399773  normal  0.0108051 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3620  hypothetical protein  56.14 
 
 		 346 aa  412  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.615774  normal  0.159076 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2550  methyltransferase type 11  58.62 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00904798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39627  predicted protein  54.89 
 
 		 410 aa  405  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  53.5 
 
 		 350 aa  351  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4641  UbiE/COQ5 methyltransferase  57.55 
 
 		 296 aa  325  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0896  Methyltransferase type 11  49.38 
 
 		 350 aa  320  3e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28006  predicted protein  50.15 
 
 		 418 aa  315  9.999999999999999e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.122244 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04661  putative methyltransferase  37.02 
 
 		 264 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4075  Methyltransferase type 11  30.03 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04351  putative methyltransferase  35.71 
 
 		 264 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4114  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 365 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.199074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0411  hypothetical protein  36.17 
 
 		 264 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0624483  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0301  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 380 aa  139  8.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0923  Methyltransferase type 11  37.24 
 
 		 1039 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  40.2 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  35.66 
 
 		 1014 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  37 
 
 		 1002 aa  135  9e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04771  putative methyltransferase  35.84 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.44 
 
 		 280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1991  methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 411 aa  133  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  34.71 
 
 		 1005 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2227  Methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 396 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372982 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  43.45 
 
 		 263 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  37.6 
 
 		 279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0677  methyltransferase-like  39.9 
 
 		 266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.17 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  39.37 
 
 		 283 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1418  methyltransferase type 11  31.41 
 
 		 379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.685062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.88 
 
 		 271 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.4 
 
 		 276 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  40.86 
 
 		 273 aa  125  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1984  methyltransferase-like  37.8 
 
 		 270 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  36.06 
 
 		 1000 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  40 
 
 		 277 aa  124  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  39.66 
 
 		 266 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08531  putative methyltransferase  38.71 
 
 		 267 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.21 
 
 		 268 aa  123  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04141  putative methyltransferase  35.38 
 
 		 241 aa  122  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  41.95 
 
 		 248 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  42.2 
 
 		 263 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1027  Methyltransferase type 11  39.15 
 
 		 258 aa  119  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  42.11 
 
 		 265 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3376  Methyltransferase type 11  47.37 
 
 		 256 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0407493  hitchhiker  0.00438973 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  38.28 
 
 		 295 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2645  methyltransferase type 11  37.99 
 
 		 262 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  39.11 
 
 		 262 aa  116  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3607  Methyltransferase type 11  29.48 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.289928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  42.11 
 
 		 265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  40.22 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  35.32 
 
 		 237 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1514  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.64 
 
 		 280 aa  114  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.732855  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1196  Methyltransferase type 11  39.66 
 
 		 259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.42 
 
 		 279 aa  112  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  39.44 
 
 		 281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  36.02 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 262 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3308  methyltransferase type 11  40.66 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358181  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3346  Methyltransferase type 11  45.24 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408224  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0104  Methyltransferase type 11  42.61 
 
 		 260 aa  106  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1636  methyltransferase type 11  35.8 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.431948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  39.89 
 
 		 264 aa  105  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3743  methyltransferase type 11  41.57 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  38.82 
 
 		 267 aa  103  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  36.61 
 
 		 274 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00700  conserved hypothetical protein  38.73 
 
 		 239 aa  102  9e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 267 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04625  arsenic methyltransferase Cyt19, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G15020)  36.9 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.2 
 
 		 266 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  40 
 
 		 246 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  38.75 
 
 		 216 aa  99.8  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1224  methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 282 aa  95.9  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.158383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2474  Methyltransferase type 11  37.08 
 
 		 226 aa  93.2  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  35.27 
 
 		 288 aa  93.2  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3171  methyltransferase type 11  36.94 
 
 		 204 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  37.85 
 
 		 355 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  37.85 
 
 		 241 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  38.73 
 
 		 209 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1914  Methyltransferase type 11  28.73 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  35.95 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  33.54 
 
 		 411 aa  82.8  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0388  type 11 methyltransferase  27.72 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4839  putative methyltransferase  39.13 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05015  hypothetical protein  25.61 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3797  hypothetical protein  27.51 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  27.45 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  35.38 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  40.83 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0786  hypothetical protein  32.8 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.27206  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  32.21 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>