More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4343 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  100 
 
 
415 aa  853    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  28.53 
 
 
323 aa  136  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 
281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3676  Methyltransferase type 11  31.6 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  28.17 
 
 
287 aa  104  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.07 
 
 
287 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  48.18 
 
 
268 aa  102  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  43.36 
 
 
277 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  41.82 
 
 
279 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0894  Methyltransferase type 11  28.25 
 
 
275 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1722  methyltransferase type 11  31.47 
 
 
280 aa  99.8  8e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0295021 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  37.13 
 
 
288 aa  96.7  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  44.55 
 
 
262 aa  96.7  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  41.03 
 
 
263 aa  96.7  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  40.71 
 
 
280 aa  95.1  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  40.71 
 
 
277 aa  95.5  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  29.12 
 
 
238 aa  95.1  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.24 
 
 
265 aa  94.4  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  42.73 
 
 
279 aa  94.4  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  34.57 
 
 
280 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  41.28 
 
 
209 aa  94  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  25.78 
 
 
251 aa  93.6  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  31.61 
 
 
272 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.81 
 
 
285 aa  93.2  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  40 
 
 
267 aa  93.2  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3003  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.46 
 
 
276 aa  92.8  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  37.35 
 
 
291 aa  92  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  41.96 
 
 
266 aa  91.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  41.07 
 
 
272 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.52 
 
 
287 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  36.2 
 
 
295 aa  90.9  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3565  Methyltransferase type 11  36.3 
 
 
288 aa  90.9  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  44.44 
 
 
283 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  44.44 
 
 
276 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  27.1 
 
 
285 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  44.44 
 
 
271 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 
298 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  45 
 
 
237 aa  87.8  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  41.07 
 
 
266 aa  87.4  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  32.94 
 
 
274 aa  87.8  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1514  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.71 
 
 
280 aa  87.4  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.732855  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubiE  30.95 
 
 
250 aa  87.8  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  32.02 
 
 
240 aa  87.4  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2118  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.95 
 
 
250 aa  87.4  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.660073  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  42.34 
 
 
274 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  39.13 
 
 
267 aa  86.3  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2645  methyltransferase type 11  38.05 
 
 
262 aa  86.7  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75506  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  40.83 
 
 
355 aa  86.3  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  33.67 
 
 
526 aa  85.9  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  42.73 
 
 
276 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  34.53 
 
 
286 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2889  methyltransferase type 11  27.34 
 
 
273 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000212071 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  39.66 
 
 
270 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1611  methyltransferase type 11  30.26 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  24.35 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0650  methyltransferase type 11  29.5 
 
 
424 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541697  normal  0.369974 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  39.82 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 
245 aa  84  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.18 
 
 
248 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.76 
 
 
215 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  40.54 
 
 
258 aa  82.4  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  37.39 
 
 
409 aa  82.4  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  39.67 
 
 
241 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  34.33 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2522  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0274503  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  27.31 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 
710 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.19 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179927  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  35.47 
 
 
711 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  26.95 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  28.72 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  38.56 
 
 
254 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4627  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  29.21 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951338  decreased coverage  0.00842858 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  29.94 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  39.29 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  27.94 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1196  Methyltransferase type 11  36.07 
 
 
259 aa  79  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  37.07 
 
 
1002 aa  79.3  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  32.96 
 
 
287 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  33.91 
 
 
124 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4839  putative methyltransferase  30 
 
 
271 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1326  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.62 
 
 
247 aa  78.6  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1099  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.71 
 
 
233 aa  78.2  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.729785  normal  0.0384798 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1224  methyltransferase type 11  43.64 
 
 
282 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.158383  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 
126 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.27 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5011  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.47 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 
271 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4885  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.47 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  27.14 
 
 
581 aa  78.2  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  37.72 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.99 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0503  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.33 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  39.09 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.5 
 
 
229 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  35.65 
 
 
411 aa  77.8  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  26 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0923  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 
1039 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4146  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.76 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4305  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.76 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>