More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2447 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  100 
 
 
284 aa  564  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  86.22 
 
 
286 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0650  methyltransferase type 11  43.81 
 
 
424 aa  155  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541697  normal  0.369974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3281  methyltransferase type 11  34.41 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  normal  0.615609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3055  methyltransferase type 11  35 
 
 
285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.346509  normal  0.0118845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  31.55 
 
 
272 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  35.62 
 
 
275 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  31.6 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.96 
 
 
285 aa  84  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3003  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.38 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  28.72 
 
 
415 aa  80.5  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  33.55 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.37 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.25 
 
 
271 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  32.95 
 
 
280 aa  79  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.36 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
209 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.18 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.03 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  35.98 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.11 
 
 
282 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.7 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.16 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.13 
 
 
287 aa  75.5  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4627  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  35.03 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951338  decreased coverage  0.00842858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.36 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  30 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.76 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.76 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.55 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.64 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.85 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  30 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  40.18 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0557  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 
206 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  35.8 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  32.74 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2043  methyltransferase type 11  39.68 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0713  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  29.3 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.919448  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0597  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  29.22 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.369183  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4188  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.55 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  37.72 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  37.72 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  32.94 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  36.45 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  33.74 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.82 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.11 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  36.28 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  35.07 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40.19 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3676  Methyltransferase type 11  33.17 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0387  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.82 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4043  methyltransferase type 11  34.55 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  37.72 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  25.82 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  39.09 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.96 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.24 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  32.28 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
339 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4785  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3760  Methyltransferase type 11  28.37 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.08 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3809  Methyltransferase type 11  28.37 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  29.65 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.35 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3341  methyltransferase type 11  26.62 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506511  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.55 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0036  putative methyltransferase  32.77 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.5 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.22 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.2 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.64 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0454  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.77 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0799871  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1722  methyltransferase type 11  25.41 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0295021 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1857  hypothetical protein  32.77 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253741  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3270  hypothetical protein  32.77 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  26.52 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5061  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.3 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0249  aklanonic acid methyl transferase  32.77 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.435744  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 
624 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30 
 
 
213 aa  67  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0036  putative methyltransferase  32.77 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  27.65 
 
 
251 aa  67  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2695  hypothetical protein  32.77 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3562  methyltransferase type 11  34.03 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122272  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  31.41 
 
 
264 aa  67  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>