More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2088 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  100 
 
 
258 aa  521  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  56.45 
 
 
254 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  56.05 
 
 
254 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  56.68 
 
 
254 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  53.33 
 
 
255 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  55.87 
 
 
254 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  53.75 
 
 
255 aa  271  7e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  53.73 
 
 
256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  54.69 
 
 
261 aa  268  5e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  57.02 
 
 
253 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  52.42 
 
 
256 aa  262  4.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  49.02 
 
 
257 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0249  Methyltransferase type 11  53.63 
 
 
260 aa  254  8e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220437  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  54.94 
 
 
259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  51 
 
 
264 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  54.15 
 
 
259 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  54.15 
 
 
259 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  49.41 
 
 
256 aa  250  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  52.19 
 
 
256 aa  250  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0336  methyltransferase type 11  51.97 
 
 
261 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.549644  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  51.59 
 
 
256 aa  248  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  51.19 
 
 
256 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  51.59 
 
 
256 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  51.19 
 
 
256 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  51.19 
 
 
256 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  50.2 
 
 
256 aa  244  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  49.4 
 
 
256 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  49.4 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  49 
 
 
256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  47.43 
 
 
254 aa  240  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  47.43 
 
 
254 aa  240  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  49.39 
 
 
250 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  48.58 
 
 
250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  49.39 
 
 
250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  49.39 
 
 
250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  49.8 
 
 
250 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  48.79 
 
 
251 aa  236  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  49.19 
 
 
250 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  48.21 
 
 
256 aa  235  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  48.99 
 
 
250 aa  235  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  48.79 
 
 
250 aa  234  8e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  48.79 
 
 
250 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  50.41 
 
 
250 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  50.41 
 
 
250 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  48.18 
 
 
250 aa  229  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  48.59 
 
 
251 aa  228  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  48.59 
 
 
251 aa  228  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2361  methyltransferase type 11  50.4 
 
 
254 aa  224  9e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0587  UbiE/COQ5 methyltransferase  47.27 
 
 
261 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  47.98 
 
 
251 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  47.79 
 
 
251 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  47.79 
 
 
251 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  47.79 
 
 
251 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  47.79 
 
 
251 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5564  methyltransferase type 11  51 
 
 
258 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  56.98 
 
 
187 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0761957 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00203  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  48.28 
 
 
207 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00208  hypothetical protein  48.28 
 
 
207 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3145  hypothetical protein  47.87 
 
 
204 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.725921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3296  hypothetical protein  47.87 
 
 
212 aa  188  5.999999999999999e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.114197  normal  0.0687983 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0206  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  47.78 
 
 
207 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3455  methyltransferase type 11  47.78 
 
 
207 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.915003  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  47.29 
 
 
207 aa  186  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  36.19 
 
 
261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  36.8 
 
 
261 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.8 
 
 
258 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.8 
 
 
258 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3284  methyltransferase type 11  47.37 
 
 
173 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.859694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.8 
 
 
261 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.8 
 
 
261 aa  169  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.8 
 
 
261 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  40.19 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  38.76 
 
 
261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  38.28 
 
 
261 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  32.2 
 
 
273 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.78 
 
 
257 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  32.37 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  41.59 
 
 
277 aa  86.3  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  40.71 
 
 
280 aa  85.1  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  40.71 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.37 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  40.54 
 
 
415 aa  82.4  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  36.28 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3752  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.51014  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.51 
 
 
250 aa  79  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.62 
 
 
207 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  33.55 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  37.12 
 
 
246 aa  77  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2269  methyltransferase type 11  36.29 
 
 
240 aa  77  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.541668  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.74 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.88 
 
 
207 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  39.13 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  39.29 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0272  methyltransferase type 11  35.21 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.52 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.69 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  39.5 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  32.62 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  32.62 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  32.62 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>