More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1008 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  100 
 
 		 256 aa  525  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  72.27 
 
 		 257 aa  394  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  71.48 
 
 		 256 aa  374  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  65.46 
 
 		 256 aa  340  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  65.46 
 
 		 256 aa  340  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  65.06 
 
 		 256 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  64.26 
 
 		 256 aa  333  2e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  63.56 
 
 		 255 aa  331  7.000000000000001e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  62.65 
 
 		 256 aa  330  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  61.04 
 
 		 256 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  61.04 
 
 		 256 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  61.04 
 
 		 256 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  61.04 
 
 		 256 aa  316  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  60.64 
 
 		 256 aa  314  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  62.1 
 
 		 254 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  61.69 
 
 		 254 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  60.89 
 
 		 254 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  60.89 
 
 		 254 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  58.96 
 
 		 255 aa  309  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3296  hypothetical protein  75.27 
 
 		 212 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.114197  normal  0.0687983 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3145  hypothetical protein  74.87 
 
 		 204 aa  302  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.725921  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  59.36 
 
 		 253 aa  299  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3284  methyltransferase type 11  75.44 
 
 		 173 aa  282  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.859694  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  53.73 
 
 		 258 aa  279  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  56.61 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00203  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  64.5 
 
 		 207 aa  271  9e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00208  hypothetical protein  64.5 
 
 		 207 aa  271  9e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0336  methyltransferase type 11  55.82 
 
 		 261 aa  271  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.549644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3455  methyltransferase type 11  64 
 
 		 207 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.915003  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  64 
 
 		 207 aa  267  8.999999999999999e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0206  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  63 
 
 		 207 aa  264  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  52.87 
 
 		 256 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  52.63 
 
 		 250 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  54.84 
 
 		 250 aa  262  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  52.23 
 
 		 250 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  52.23 
 
 		 250 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.42 
 
 		 251 aa  261  8e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  51.63 
 
 		 250 aa  259  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  52.23 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  52.63 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  52.23 
 
 		 250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  52.02 
 
 		 254 aa  256  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  52.02 
 
 		 254 aa  256  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  51.42 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  51.63 
 
 		 250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.82 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.82 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  52.96 
 
 		 259 aa  253  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  53.75 
 
 		 259 aa  251  6e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  53.75 
 
 		 259 aa  249  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  49.59 
 
 		 256 aa  248  5e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.02 
 
 		 251 aa  248  7e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.02 
 
 		 251 aa  248  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.02 
 
 		 251 aa  248  7e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.02 
 
 		 251 aa  248  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.02 
 
 		 251 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0249  Methyltransferase type 11  51.01 
 
 		 260 aa  246  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220437  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  46.06 
 
 		 264 aa  245  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  52.07 
 
 		 250 aa  238  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  52.07 
 
 		 250 aa  238  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  62.37 
 
 		 187 aa  237  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0761957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5564  methyltransferase type 11  53.41 
 
 		 258 aa  236  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0587  UbiE/COQ5 methyltransferase  51.01 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846793  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2361  methyltransferase type 11  48 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.8 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  32.8 
 
 		 261 aa  153  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.8 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  32 
 
 		 261 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.07 
 
 		 261 aa  145  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.6 
 
 		 261 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  35.41 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  32.02 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.89 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  34.93 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.22 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.5 
 
 		 259 aa  99.4  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 253 aa  93.2  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  38.13 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  43.44 
 
 		 248 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  32.89 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.21 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.07 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  41.23 
 
 		 209 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  37.08 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  40.16 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  42.24 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  39.81 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  44.25 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  35.62 
 
 		 312 aa  78.6  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2319  generic methyltransferase  34.58 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.897419  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  35.71 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.59 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.29 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  45.45 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2269  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.541668  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 1002 aa  77.8  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2395  Methyltransferase type 11  34.72 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000965249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.75 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  41.44 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>