More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0400 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  100 
 
 		 248 aa  497  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  78.78 
 
 		 250 aa  395  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 266 aa  122  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4216  methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  46.9 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  46.02 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  45.13 
 
 		 254 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  44.25 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.5 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08181  hypothetical protein  32.2 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.56465  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  41.41 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  42.34 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  43.44 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  38.98 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.88 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.88 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  38.99 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  41.03 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.58 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  42.42 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.58 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  38.16 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 332 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  45.1 
 
 		 341 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.17 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  39.29 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  40.35 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  44.54 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  36.8 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.58 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  36.29 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.68 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  34.9 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.68 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.68 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.68 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  45.1 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.84 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1460  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  38.74 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.11 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  39.22 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  39.42 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  40 
 
 		 274 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.57 
 
 		 278 aa  67  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.58 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.11 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  38.05 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2490  Methyltransferase type 11  33.52 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43.24 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2016  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.82 
 
 		 299 aa  65.5  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  38.58 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  38.26 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  38.26 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  38.26 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  30.06 
 
 		 238 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.39 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.5 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  38.98 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  40.4 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  36.79 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1272  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  43.75 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0761957 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  36.22 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  29.45 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4848  Methyltransferase type 11  41.51 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  37.01 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43.24 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  40 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  37.5 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  39.47 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.25 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  25.27 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3296  hypothetical protein  35.71 
 
 		 212 aa  62  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.114197  normal  0.0687983 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  39.34 
 
 		 263 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  37.01 
 
 		 259 aa  62  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0597  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  38.18 
 
 		 248 aa  62  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.369183  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  41 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  37.5 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2605  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.06 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0775549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  39.39 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  37.5 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4023  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.82 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.63 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  37.5 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3145  hypothetical protein  35.71 
 
 		 204 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.725921  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.45 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>