More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2361 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2361  methyltransferase type 11  100 
 
 		 254 aa  500  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0249  Methyltransferase type 11  83.08 
 
 		 260 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220437  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  56.8 
 
 		 264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  61.04 
 
 		 259 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  60.24 
 
 		 259 aa  264  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  59.84 
 
 		 259 aa  259  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  52.24 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0336  methyltransferase type 11  55.56 
 
 		 261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.549644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  50.4 
 
 		 258 aa  246  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  52.42 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5564  methyltransferase type 11  60.8 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  49.8 
 
 		 255 aa  241  6e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  51.85 
 
 		 261 aa  236  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  50.81 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  48 
 
 		 256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  50.81 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  45.78 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  45.63 
 
 		 256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  50.41 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  48.81 
 
 		 256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  50 
 
 		 254 aa  231  6e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  50 
 
 		 254 aa  231  6e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  50.61 
 
 		 256 aa  231  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  47.22 
 
 		 256 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  47.22 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  48.78 
 
 		 254 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  46.43 
 
 		 256 aa  228  7e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  51.64 
 
 		 250 aa  225  7e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  51.64 
 
 		 250 aa  225  7e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  47.41 
 
 		 256 aa  224  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  47.41 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  47.01 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  46.59 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  47.01 
 
 		 256 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  45.24 
 
 		 256 aa  223  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  50.8 
 
 		 250 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  47.01 
 
 		 256 aa  221  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  49.6 
 
 		 251 aa  221  9e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  49.19 
 
 		 250 aa  221  9e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  49 
 
 		 250 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  48.39 
 
 		 250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  49 
 
 		 250 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  49 
 
 		 250 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  50 
 
 		 250 aa  218  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  46.99 
 
 		 250 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  49 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  47.01 
 
 		 256 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  48 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  48 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0587  UbiE/COQ5 methyltransferase  47.49 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  47.6 
 
 		 251 aa  201  8e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  47.2 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  47.2 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  47.2 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  47.2 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  52.97 
 
 		 187 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0761957 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3145  hypothetical protein  47.24 
 
 		 204 aa  188  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.725921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3296  hypothetical protein  46.23 
 
 		 212 aa  186  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.114197  normal  0.0687983 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  46.08 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00203  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  45.1 
 
 		 207 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00208  hypothetical protein  45.1 
 
 		 207 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0206  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  45.59 
 
 		 207 aa  181  9.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3455  methyltransferase type 11  44.61 
 
 		 207 aa  180  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.915003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3284  methyltransferase type 11  50.9 
 
 		 173 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.859694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  32.35 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  33.76 
 
 		 264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.51 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.35 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.12 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  31.51 
 
 		 261 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.12 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.93 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.93 
 
 		 261 aa  141  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.93 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  32.78 
 
 		 273 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.7 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  34.25 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  33.09 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  30.82 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.57 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3752  Methyltransferase type 11  34.1 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.51014  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4638  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.73 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0233383 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0632  type 11 methyltransferase  39.85 
 
 		 204 aa  67  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.186651 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  36.88 
 
 		 229 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.86 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.08 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  40.95 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3572  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.05 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000345623 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  32.62 
 
 		 634 aa  65.5  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0289  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  35.45 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  25.87 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  25.87 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  25.87 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  25.87 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0466  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.45 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0388  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.57 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  25.87 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  25.87 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>