More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0632 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0632  type 11 methyltransferase  100 
 
 
204 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.186651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4035  methyltransferase type 11  59.9 
 
 
203 aa  226  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.237399  normal  0.211519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  62.92 
 
 
178 aa  204  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2069  methyltransferase type 11  60.91 
 
 
207 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0598804  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2086  methyltransferase type 11  60.91 
 
 
207 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0379374  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2132  methyltransferase type 11  60.91 
 
 
207 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0115408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  37.6 
 
 
257 aa  74.7  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.57 
 
 
256 aa  74.7  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  38.28 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  39.06 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.12 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  38.28 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  35.64 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.12 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  38.28 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  38.28 
 
 
256 aa  71.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  34.23 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  39.52 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  36.51 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  42.98 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  42.11 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.71 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  37.93 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  42.11 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.71 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  36.8 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  31.87 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12710  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.64 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  32.97 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3346  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
265 aa  65.1  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408224  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2269  methyltransferase type 11  31.78 
 
 
240 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.541668  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 
273 aa  65.1  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  35.35 
 
 
319 aa  64.7  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  34.87 
 
 
210 aa  64.7  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.23 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  33.33 
 
 
258 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.23 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.61 
 
 
215 aa  63.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.23 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.23 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  40.2 
 
 
312 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  29.48 
 
 
267 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.09 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.36 
 
 
230 aa  63.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5925  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.32 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1224  methyltransferase type 11  33.82 
 
 
282 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.158383  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.35 
 
 
251 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  38.74 
 
 
233 aa  62.8  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  30.11 
 
 
274 aa  62.8  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  31.05 
 
 
206 aa  62.4  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  32.7 
 
 
261 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.35 
 
 
258 aa  62.4  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  37.96 
 
 
256 aa  62  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  28.99 
 
 
262 aa  62  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  36.32 
 
 
276 aa  62  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
348 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  38.93 
 
 
274 aa  62  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  35.04 
 
 
255 aa  61.6  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
283 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  32 
 
 
355 aa  61.6  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0272  methyltransferase type 11  36.89 
 
 
182 aa  61.2  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  39.69 
 
 
274 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 
206 aa  60.8  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.54 
 
 
279 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.29 
 
 
270 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  33.06 
 
 
256 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  31.93 
 
 
250 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  31.03 
 
 
244 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  41.03 
 
 
250 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  37.38 
 
 
256 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.9 
 
 
280 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  34.03 
 
 
268 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  40.19 
 
 
217 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  35 
 
 
255 aa  59.7  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
226 aa  59.3  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
258 aa  59.7  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  39.25 
 
 
269 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
283 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.48 
 
 
305 aa  59.3  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.71 
 
 
255 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4208  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
271 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195862  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  35.79 
 
 
244 aa  58.9  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  30 
 
 
261 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
309 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  31.06 
 
 
307 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.69 
 
 
237 aa  58.5  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2910  putative RNA methylase  39.09 
 
 
210 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.094641 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16171  hypothetical protein  28.85 
 
 
287 aa  58.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0216  methyltransferase type 11  34.75 
 
 
184 aa  58.5  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.709398  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.71 
 
 
280 aa  58.2  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  27.49 
 
 
301 aa  58.5  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.79 
 
 
252 aa  58.5  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
265 aa  58.2  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  31.96 
 
 
205 aa  58.2  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2361  methyltransferase type 11  37.27 
 
 
254 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  32.32 
 
 
281 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  31.87 
 
 
307 aa  58.2  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  30.84 
 
 
280 aa  58.2  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>