More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_12710 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_12710  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 		 198 aa  390  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4275  methyltransferase type 11  40.69 
 
 		 236 aa  90.1  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1282  methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  37.65 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2597  methyltransferase type 11  33.15 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.254327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10334  hypothetical protein  34.07 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.672272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6157  Methyltransferase type 11  33.14 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  34 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0632  type 11 methyltransferase  30.64 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.186651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  40.35 
 
 		 265 aa  64.7  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1964  methyltransferase type 11  31.84 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2010  methyltransferase type 11  31.84 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1944  methyltransferase type 11  31.84 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.108807  normal  0.982721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  43 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  32.53 
 
 		 276 aa  61.6  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2269  methyltransferase type 11  32.8 
 
 		 240 aa  61.2  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.541668  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  36 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6852  Methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal  0.739847 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  36 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  35.43 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1057  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.783467  hitchhiker  0.00010073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4035  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.237399  normal  0.211519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  39.6 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1996  generic methyltransferase  32.04 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  40.59 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.88 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1594  methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  37.6 
 
 		 283 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 348 aa  58.2  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0984  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 300 aa  58.2  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0025  methyltransferase type 11  37.62 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.98 
 
 		 256 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  40 
 
 		 1014 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  40 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2645  methyltransferase type 11  36.22 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.37 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  34 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 281 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.37 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.74 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2195  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  38.38 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 281 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2418  Methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224648 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 257 aa  57  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1914  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3346  Methyltransferase type 11  38.94 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408224  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5114  Methyltransferase type 11  32.81 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.947305 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.35 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2086  methyltransferase type 11  31.72 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0379374  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2132  methyltransferase type 11  31.72 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0115408 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1161  methyltransferase type 11  23.13 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2069  methyltransferase type 11  31.72 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0598804  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1512  methyltransferase type 11  22.7 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0699  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0634895  normal  0.912408 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0725  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  34.21 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.09 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 329 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  30.83 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1411  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.456001  normal  0.135358 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.4 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2014  methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.51029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  37.19 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 333 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  34.4 
 
 		 295 aa  55.1  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.21 
 
 		 280 aa  54.7  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  41.77 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2109  methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 296 aa  54.7  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.709004  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.4 
 
 		 266 aa  54.7  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.19 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 275 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  38.38 
 
 		 256 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0559  methyltransferase type 11  34.33 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2526  methyltransferase type 11  31.51 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981998 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.21 
 
 		 277 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3145  hypothetical protein  29.21 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.725921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3296  hypothetical protein  29.21 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.114197  normal  0.0687983 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0206  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.94 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3376  Methyltransferase type 11  39.29 
 
 		 256 aa  53.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0407493  hitchhiker  0.00438973 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  38.06 
 
 		 312 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  28.38 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  35.82 
 
 		 270 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.74 
 
 		 238 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 		 1106 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.53 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  29.41 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>