More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0502 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  100 
 
 		 217 aa  430  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  88.43 
 
 		 217 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  59.33 
 
 		 210 aa  232  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  55.81 
 
 		 220 aa  220  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  56 
 
 		 208 aa  214  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  53.92 
 
 		 203 aa  209  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  52.38 
 
 		 217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  49.5 
 
 		 209 aa  185  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  50.99 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  46.41 
 
 		 212 aa  168  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  45.28 
 
 		 215 aa  166  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  45.92 
 
 		 218 aa  152  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  41.35 
 
 		 200 aa  142  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  43.78 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  42.38 
 
 		 228 aa  138  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  46.84 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  38.07 
 
 		 200 aa  122  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  38.34 
 
 		 197 aa  118  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.23 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4405  Methyltransferase type 11  36.82 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.432448  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.32 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  42.03 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2718  Methyltransferase type 12  34.63 
 
 		 204 aa  95.1  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  38.14 
 
 		 400 aa  94.7  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  46.15 
 
 		 201 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  46.15 
 
 		 201 aa  89  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  46.15 
 
 		 201 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  46.15 
 
 		 201 aa  89  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  46.15 
 
 		 201 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  46.15 
 
 		 201 aa  89  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  41.78 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0915  Methyltransferase type 12  33.69 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5571  methyltransferase  42.61 
 
 		 121 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.766224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  30.16 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  27.15 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  37.06 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1453  SAM-dependent methyltransferase  34.46 
 
 		 252 aa  72  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.938233  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0757  methyltransferase type 11  41.01 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.137769  normal  0.156895 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5869  hypothetical protein  37.68 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0641287  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  43.88 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  34.59 
 
 		 267 aa  68.2  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  30.16 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  32.43 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  34.67 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  32.22 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  32.7 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  31.08 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  33.56 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  37.41 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  41.75 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  31.37 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  32.08 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.31 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.911002 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  39.45 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.72 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  40.95 
 
 		 267 aa  62  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  33.8 
 
 		 208 aa  62  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2586  methyltransferase type 11  39.6 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.322136  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.04 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  29.65 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  25.33 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0522  methyltransferase type 11  38.6 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146489  normal  0.549462 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2562  methyltransferase type 11  36.23 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290266  normal  0.0304213 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0632  type 11 methyltransferase  40.19 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.186651 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1926  methyltransferase type 11  36.96 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  29.27 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2538  methyltransferase type 11  36.96 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0718588  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  36.62 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  29.9 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  33.55 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.69 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 551 aa  58.9  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  32.12 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  27.89 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  30.86 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  29.58 
 
 		 337 aa  58.5  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  26.02 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.88 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  24.08 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0152  methyltransferase type 11  27.63 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.57 
 
 		 262 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.21 
 
 		 258 aa  58.2  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  29.01 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4043  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>