More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4063 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  100 
 
 
319 aa  640    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  51.61 
 
 
305 aa  282  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  48.57 
 
 
291 aa  223  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  30.15 
 
 
207 aa  90.1  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0221  Methyltransferase type 11  26.26 
 
 
208 aa  85.9  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.92 
 
 
249 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
457 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.75 
 
 
249 aa  82.4  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  33.16 
 
 
219 aa  78.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  33.1 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  32.33 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
249 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  38.06 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  40.52 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  30.08 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  33.1 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  31.51 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  36.21 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  30.77 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.19 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.69 
 
 
258 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  30.99 
 
 
235 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 
200 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  41.8 
 
 
246 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  38.79 
 
 
259 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  41.8 
 
 
246 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  31.69 
 
 
235 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  43.1 
 
 
246 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 
200 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.93 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  41.88 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.93 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  38.05 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  29.55 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  39.67 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  30.13 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.62 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  34.58 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.69 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  40.95 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  39.66 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  42 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.4 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  32.34 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.12 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.165122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0240  methyltransferase type 11  31.61 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.164188 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  31.45 
 
 
232 aa  69.3  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  30.13 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  36.43 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  36.79 
 
 
253 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.37 
 
 
240 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  40.16 
 
 
216 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2263  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
232 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.28 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  31.07 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 
214 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  40.16 
 
 
216 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.39 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  39.66 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  32.86 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  36.96 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  37.3 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.51 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1820  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  38.68 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  34.65 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  32.48 
 
 
629 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1352  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.45 
 
 
251 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  33.09 
 
 
213 aa  67  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.45 
 
 
251 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  37.76 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  36.73 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  37.14 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  40.38 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  40.38 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  41.75 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  31.79 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  40.38 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  26.17 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  32.12 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  39.39 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  33.9 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  28 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  34.48 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  30.07 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.62 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2739  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  31.62 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.34 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2360  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.175254  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
328 aa  65.9  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1055  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.82 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>