More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1544 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 200 aa  414  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  40.11 
 
 		 222 aa  148  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 196 aa  101  8e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  28.93 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  28.93 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  29.74 
 
 		 222 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  35.95 
 
 		 203 aa  87.8  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 364 aa  85.5  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  35.86 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  34.48 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  26.6 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  29.65 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  31.88 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  32.86 
 
 		 1287 aa  75.5  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  25.65 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  29.8 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  26.21 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  26.86 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  31.03 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  25.79 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  25.81 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  30.97 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  25 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  30.97 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  30.97 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  31.62 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  29.5 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  30.97 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  30.97 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  30.97 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  26.17 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  30.86 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  25.6 
 
 		 575 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  25.16 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  26.25 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  27.75 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  31.93 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  24.12 
 
 		 551 aa  64.7  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  30.37 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  31.25 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  31.39 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  34.92 
 
 		 253 aa  62  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  33.82 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  36.36 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  31.79 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  31.25 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  31.39 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  30.66 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  29.08 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  30.47 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  29.08 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  31.17 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2004  methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.388226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  24.19 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  27.42 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  35.96 
 
 		 663 aa  58.9  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  31.64 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 442 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  29.34 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 251 aa  57.8  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  27.01 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01393  hypothetical protein  22.29 
 
 		 535 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.15 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.8 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  25.51 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  32.17 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  26.19 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  25.45 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0714  methyltransferase  30.71 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0757  methyltransferase type 11  44.78 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.137769  normal  0.156895 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  28.92 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  28.92 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  31.25 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  27.75 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  31.01 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  28.26 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  24.12 
 
 		 440 aa  55.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2438  putative methyltransferase  29.31 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_56585  predicted protein  29.08 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.87 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  27.61 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  29.23 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>