More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4412 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  100 
 
 		 303 aa  629  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 317 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 330 aa  112  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  31.65 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  29.96 
 
 		 282 aa  108  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  28.79 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  28.79 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  26.18 
 
 		 318 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  26.67 
 
 		 342 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  25.88 
 
 		 358 aa  104  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  27.56 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  31.44 
 
 		 310 aa  103  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 310 aa  102  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  36.3 
 
 		 214 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 267 aa  98.6  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  28.24 
 
 		 275 aa  98.2  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  25 
 
 		 286 aa  94  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  25.44 
 
 		 306 aa  92.8  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  26.15 
 
 		 273 aa  92  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  27.4 
 
 		 277 aa  91.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  25.81 
 
 		 314 aa  90.1  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  31.43 
 
 		 311 aa  90.1  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 306 aa  89.7  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  27.24 
 
 		 308 aa  89.4  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  25.75 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  26.67 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  28.64 
 
 		 333 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  25.31 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  31.76 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  26.53 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  23.81 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  28.14 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  28.14 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  24.61 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.41 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  27.8 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  28.29 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  23.81 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  26.67 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  26.34 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  26.61 
 
 		 672 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  25.11 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  27.22 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  24.5 
 
 		 625 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  25.58 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  24.89 
 
 		 240 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  23.61 
 
 		 248 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  26.84 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1217  Methyltransferase type 12  25.24 
 
 		 607 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  25.62 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 		 996 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3474  Methyltransferase type 12  22.52 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  25.1 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  26.88 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  29.61 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  24.55 
 
 		 513 aa  65.9  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  27.08 
 
 		 346 aa  65.5  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  23.85 
 
 		 326 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 		 1523 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  29.33 
 
 		 229 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  29.61 
 
 		 229 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  26.89 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  30.46 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  26.54 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  28.67 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  28.29 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  26.91 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.74 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  28.29 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  28.67 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  28.67 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  28.67 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  28.67 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  20.93 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  38 
 
 		 194 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2011  hypothetical protein  26.85 
 
 		 199 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.714234 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 197 aa  62  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1124 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  27.95 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  23.85 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25.77 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1484  glycosyl transferase WecB/TagA/CpsF  26.03 
 
 		 574 aa  61.6  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000853936  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.79 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  31.2 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2263  Methyltransferase type 11  24.46 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  26.21 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3318  methyltransferase type 12  26.44 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434757 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  27.89 
 
 		 1340 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.01 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  24.35 
 
 		 1162 aa  58.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.87 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.81 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 		 1177 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3104  methyltransferase type 12  24.88 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2104  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like protein  23.15 
 
 		 304 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3809  methyltransferase type 11  24.26 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 		 1177 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  27.87 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>