More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2381 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
209 aa  429  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  66.67 
 
 
207 aa  255  4e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  62.44 
 
 
201 aa  242  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  55.78 
 
 
211 aa  210  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  51.98 
 
 
212 aa  208  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  48.54 
 
 
208 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  49.51 
 
 
217 aa  201  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  49.03 
 
 
204 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  49.51 
 
 
204 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  46.5 
 
 
221 aa  188  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0754  methyltransferase type 11  50 
 
 
198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000237312  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0765  SAM-dependent methyltransferase  49.49 
 
 
213 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2424  methyltransferase type 11  49.49 
 
 
213 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.226259 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  44.72 
 
 
200 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1041  Methyltransferase type 11  45.83 
 
 
167 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.417194 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  40.4 
 
 
195 aa  142  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  43.32 
 
 
200 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  42.23 
 
 
201 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  38.07 
 
 
197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  41.67 
 
 
201 aa  135  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  37.06 
 
 
201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  37.06 
 
 
199 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  38.58 
 
 
194 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  40.8 
 
 
199 aa  127  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  35.53 
 
 
200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  35.53 
 
 
200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  41 
 
 
200 aa  126  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5848  hypothetical protein  37.56 
 
 
194 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00432181  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_56585  predicted protein  36.1 
 
 
235 aa  122  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  33.5 
 
 
200 aa  119  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  36.18 
 
 
198 aa  116  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  33.67 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2244  tellurite resistance protein TehB  32.45 
 
 
205 aa  102  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.926743  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4631  methyltransferase type 11  31.86 
 
 
207 aa  97.8  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  41.77 
 
 
207 aa  95.9  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3784  tellurite resistance protein TehB, putative  30.69 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.100307 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  38.82 
 
 
149 aa  87  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  36.42 
 
 
218 aa  85.9  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  36.96 
 
 
190 aa  84  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  36.23 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4951  Methyltransferase type 12  33.17 
 
 
204 aa  81.3  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  38.62 
 
 
253 aa  78.2  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2302  hypothetical protein  28.71 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  34.15 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  34.04 
 
 
190 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  33.99 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  31.67 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  31.45 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  34.19 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  33 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  30.65 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1171  methyltransferase type 11  36.23 
 
 
544 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.795011 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  37.79 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  31.1 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  34.27 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  28.93 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  32.13 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  29.71 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  29.23 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  30.71 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  29.32 
 
 
236 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  29.32 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  29.32 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  29.32 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  29.32 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  30.05 
 
 
226 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  28.8 
 
 
236 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  34.78 
 
 
214 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  32.43 
 
 
215 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  27.53 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  29.59 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  27.32 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 
199 aa  60.5  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  27.53 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 
218 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  25.97 
 
 
277 aa  59.3  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  31.52 
 
 
198 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2902  methyltransferase type 12  37.23 
 
 
183 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2946  methyltransferase type 12  37.23 
 
 
183 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2932  methyltransferase type 12  35.35 
 
 
188 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202849  normal  0.0386986 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1011  methyltransferase, putative  36.59 
 
 
262 aa  58.2  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472395  normal  0.034606 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  29.34 
 
 
200 aa  58.2  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  29.47 
 
 
188 aa  58.2  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0972  hypothetical protein  26.82 
 
 
177 aa  57.4  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  32.04 
 
 
191 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  30.64 
 
 
196 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  31.33 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  30.17 
 
 
290 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  35.54 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0410  hypothetical protein  45.16 
 
 
70 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  29.63 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  26.55 
 
 
182 aa  56.6  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
216 aa  57  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
270 aa  57  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 
210 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  27.21 
 
 
174 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 
195 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3626  methyltransferase type 12  29.14 
 
 
181 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>