More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1254 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  100 
 
 
244 aa  498  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  38.31 
 
 
254 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  34.96 
 
 
251 aa  146  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  38.96 
 
 
258 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  34.43 
 
 
244 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  34.68 
 
 
261 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  32.93 
 
 
248 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  32.93 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  32.53 
 
 
248 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  32.4 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  33.33 
 
 
243 aa  137  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  35.66 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  30.42 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  33.75 
 
 
242 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  31.05 
 
 
251 aa  122  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 
249 aa  122  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  37.98 
 
 
276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  34.02 
 
 
233 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  28.63 
 
 
292 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  35.16 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  31.05 
 
 
249 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  29.44 
 
 
318 aa  105  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  30.16 
 
 
311 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  27.8 
 
 
289 aa  99  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  28.98 
 
 
288 aa  98.6  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5370  Methyltransferase type 11  27.8 
 
 
288 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.328033 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3855  Methyltransferase type 12  36.02 
 
 
249 aa  89.7  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1003  hypothetical protein  29.26 
 
 
237 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1485  hypothetical protein  29.26 
 
 
237 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4625  hypothetical protein  28.63 
 
 
237 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394037  normal  0.982559 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1461  hypothetical protein  29.26 
 
 
237 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321475  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3939  Methyltransferase type 12  33.88 
 
 
249 aa  85.5  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1380  hypothetical protein  29.57 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0292  MCP methyltransferase, CheR-type  31.05 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  38.85 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1757  methylase  27.39 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  29.96 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  31.89 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  30.08 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2661  hypothetical protein  34.19 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.588792  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1368  hypothetical protein  29 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1408  hypothetical protein  29 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  29.85 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  28.22 
 
 
263 aa  78.6  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  32.6 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3413  Methyltransferase type 12  27.84 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
531 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1376  Methyltransferase type 11  31.91 
 
 
274 aa  77  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.331989 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  37.76 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  26.95 
 
 
527 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
527 aa  75.5  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  33.92 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  32.77 
 
 
241 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  34.03 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  36.81 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  38.93 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  37.23 
 
 
1032 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  41.35 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  38 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  40.87 
 
 
711 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.94 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 
519 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  30.51 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  39.84 
 
 
710 aa  72.4  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  31.74 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  27.75 
 
 
239 aa  72  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  44.94 
 
 
259 aa  71.6  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  32.09 
 
 
401 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  37.98 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  38 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  32.22 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  27.36 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  32.22 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  32.22 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1102  methyltransferase type 11  33.13 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  30.46 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  42.15 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.37 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.37 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  39.81 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 
284 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  41 
 
 
429 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6874  Methyltransferase type 11  32.72 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413969  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  41.07 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  29.47 
 
 
253 aa  68.6  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  42.57 
 
 
258 aa  68.6  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  42.06 
 
 
194 aa  68.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  27.81 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.28 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  33.12 
 
 
248 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  33.12 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  39.78 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 
271 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  31.94 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  42 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>