More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2456 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  100 
 
 		 217 aa  424  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  88.43 
 
 		 217 aa  382  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  56.67 
 
 		 210 aa  220  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  55.45 
 
 		 208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  56.6 
 
 		 220 aa  218  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  54.9 
 
 		 203 aa  201  8e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  52.38 
 
 		 217 aa  198  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  50.25 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  51.5 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  46.89 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  46.48 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  44.62 
 
 		 218 aa  147  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  45.83 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  43.28 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  46.84 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  40 
 
 		 200 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  40.62 
 
 		 200 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  40.41 
 
 		 197 aa  128  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.89 
 
 		 200 aa  126  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4405  Methyltransferase type 11  36.95 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.432448  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.21 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  41.3 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  38.32 
 
 		 400 aa  97.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2718  Methyltransferase type 12  34.95 
 
 		 204 aa  94.7  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5571  methyltransferase  45.61 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.766224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  37.93 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  41.75 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  41.75 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  41.75 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  41.75 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  41.75 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  41.75 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0915  Methyltransferase type 12  31.85 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  25.83 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  43.86 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  30.22 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  38.57 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  44.12 
 
 		 226 aa  72  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  36.62 
 
 		 214 aa  72  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  36.88 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  36.67 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  38.19 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  31.54 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0757  methyltransferase type 11  40 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.137769  normal  0.156895 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  37.42 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  31.03 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  34.97 
 
 		 250 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  33.79 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  31.69 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  41.05 
 
 		 319 aa  65.5  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1453  SAM-dependent methyltransferase  30.41 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.938233  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  34.9 
 
 		 255 aa  65.1  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  30.77 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  38.68 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  34.39 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  37.27 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  33.11 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  38.57 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  38.57 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  42.99 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  39.57 
 
 		 243 aa  62  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 225 aa  62  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2664  methyltransferase type 11  23.76 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000744585  normal  0.0352829 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  29.9 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5869  hypothetical protein  34.78 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0641287  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  38.46 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  23.81 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  37.32 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0152  methyltransferase type 11  27.63 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  30.72 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  30.67 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  32.05 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  32.05 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  36.69 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  32.05 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  39.18 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  35.03 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  27.23 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  26.15 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  29.82 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 309 aa  58.5  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 		 551 aa  57.8  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2586  methyltransferase type 11  37 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.322136  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2249  methyltransferase type 12  27.38 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.200806 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  28.21 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  31.63 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0899  methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2370  methyltransferase type 11  26.97 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258532 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 286 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1603  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.33 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.905646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>