292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4405 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4405  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 210 aa  422  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.432448  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2718  Methyltransferase type 12  53.43 
 
 		 204 aa  197  7e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  37 
 
 		 210 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  36.95 
 
 		 217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  35.61 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  36.82 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37 
 
 		 203 aa  115  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  32.16 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  36.14 
 
 		 220 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  35.2 
 
 		 200 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.99 
 
 		 217 aa  95.5  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  39.87 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 218 aa  92  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.64 
 
 		 200 aa  89.4  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  32.5 
 
 		 200 aa  84.7  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  34.16 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.65 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  36.57 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  33.53 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  32.7 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  35.95 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  32.37 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  26.44 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  37.14 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.78 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2128  methyltransferase type 11  50.68 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.26918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  25.58 
 
 		 259 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 272 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0915  Methyltransferase type 12  30.08 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  32.19 
 
 		 269 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  43.9 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  25.42 
 
 		 264 aa  52.4  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  29.36 
 
 		 258 aa  52  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  32.2 
 
 		 253 aa  52  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.25 
 
 		 155 aa  52  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  32.58 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 202 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 		 251 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1554  hypothetical protein  33.03 
 
 		 315 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000923024  normal  0.0128521 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1067  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 272 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  42.03 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  21.43 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  27.19 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  33.64 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 243 aa  49.7  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  35.53 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  46.94 
 
 		 258 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 254 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2432  methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 259 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  35.53 
 
 		 251 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  32.24 
 
 		 275 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  30.19 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2138  Methyltransferase type 11  50 
 
 		 260 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4608  methyltransferase type 11  35.66 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4890  methyltransferase type 12  41.67 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.909319  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 		 251 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  40 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 		 251 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  42 
 
 		 258 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  29.66 
 
 		 258 aa  48.9  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1418  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 245 aa  48.9  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.291463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  32.04 
 
 		 1106 aa  48.9  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  27.69 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  38.16 
 
 		 253 aa  48.9  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  28 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3953  Methyltransferase type 12  44.59 
 
 		 249 aa  48.5  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.988562  normal  0.116443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  42.03 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 224 aa  48.5  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  42.03 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  42.03 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.33 
 
 		 232 aa  48.5  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.060018  normal  0.471088 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1885  putative methyltransferase  23.78 
 
 		 242 aa  48.5  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2555  methyltransferase type 12  36.9 
 
 		 226 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0699179  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  28.29 
 
 		 234 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  34.78 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  34.78 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  37.37 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  34.21 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  34.21 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 253 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  30.71 
 
 		 296 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.07 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  34.21 
 
 		 251 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  34.78 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  34.78 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  34.78 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  27.12 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  28 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>