202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2664 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2664  methyltransferase type 11  100 
 
 		 210 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000744585  normal  0.0352829 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1969  methyltransferase type 11  62.38 
 
 		 214 aa  291  6e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00620087  normal  0.0463791 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2370  methyltransferase type 11  50 
 
 		 219 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258532 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  50 
 
 		 215 aa  198  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2249  methyltransferase type 12  44.34 
 
 		 217 aa  185  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.200806 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1373  methyltransferase type 12  42.41 
 
 		 226 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  32.24 
 
 		 221 aa  122  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3312  hypothetical protein  32.67 
 
 		 211 aa  112  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1771  hypothetical protein  47.31 
 
 		 120 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.852905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  23.38 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  23.76 
 
 		 217 aa  62  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  27.74 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  22.71 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  22.4 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  24.83 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0890  hypothetical protein  29.2 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf339  predicted O-methyltransferase  29.45 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00322712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.89 
 
 		 268 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  25.77 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  23.93 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1419  methyltransferase type 11  24.64 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  23.5 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  24 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  26.17 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  25.97 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  20.71 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2839  methyltransferase type 12  25.25 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323425  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0422  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 270 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731942  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  23.78 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  21.74 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  23.44 
 
 		 317 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  28.24 
 
 		 264 aa  52.4  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  24.37 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3392  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.75 
 
 		 221 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4124  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.75 
 
 		 261 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  27.1 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  22.94 
 
 		 217 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4775  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.12 
 
 		 253 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  23.24 
 
 		 228 aa  51.6  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.75 
 
 		 261 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.95 
 
 		 262 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  23.81 
 
 		 400 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.91 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  27.42 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  32.19 
 
 		 244 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  26.9 
 
 		 259 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  25.81 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  26.47 
 
 		 423 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54050  hypothetical protein  27.22 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  27.59 
 
 		 272 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  26.21 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.46 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  26.62 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  22.09 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  25.69 
 
 		 283 aa  50.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1749  methyltransferase type 12  34.86 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.110719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.78 
 
 		 260 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  24.46 
 
 		 269 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  25.17 
 
 		 228 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  23.17 
 
 		 390 aa  48.9  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  27.1 
 
 		 258 aa  48.9  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  21.92 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  19.37 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  26.23 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  25.9 
 
 		 269 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25 
 
 		 224 aa  48.5  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  23 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  25.86 
 
 		 400 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  22.6 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7775  hypothetical protein  28.83 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3731  Methyltransferase type 11  27.13 
 
 		 298 aa  47.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  25 
 
 		 285 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  25.45 
 
 		 285 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  27.64 
 
 		 415 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.76 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.911002 
 
 
-
 
NC_004310  BR1455  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.25 
 
 		 255 aa  46.6  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.16 
 
 		 241 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.18 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3158  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.69 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1410  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.25 
 
 		 255 aa  46.6  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  25.6 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.23 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  35.05 
 
 		 276 aa  46.6  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  24.74 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  28.33 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1190  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.53 
 
 		 241 aa  45.8  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2549  adenylylsulfate kinase  23.81 
 
 		 388 aa  46.2  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.064569 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  25.96 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  23.49 
 
 		 524 aa  46.2  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3506  methyltransferase type 11  21.43 
 
 		 299 aa  45.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0252  Methyltransferase type 12  23.36 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.965523  hitchhiker  0.00106675 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.47 
 
 		 258 aa  45.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  25 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 251 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  28.87 
 
 		 263 aa  45.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  23.02 
 
 		 269 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  25.95 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.920787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>