230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0422 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0422  Methyltransferase type 11  100 
 
 
270 aa  557  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731942  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  40.17 
 
 
1288 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
341 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
332 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 
331 aa  59.3  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 
324 aa  59.3  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.23 
 
 
325 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  34.58 
 
 
327 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1554  hypothetical protein  30.3 
 
 
315 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000923024  normal  0.0128521 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3762  hypothetical protein  31.87 
 
 
315 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000334692  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3731  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 
298 aa  55.8  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  30.83 
 
 
328 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  30.83 
 
 
328 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  30.83 
 
 
328 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0009  hypothetical protein  37.86 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.62 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2889  methyltransferase type 11  40.98 
 
 
273 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000212071 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2207  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
219 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  32.76 
 
 
268 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  27.03 
 
 
320 aa  53.9  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 
215 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  26.96 
 
 
263 aa  53.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0972  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
269 aa  53.1  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.191025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3444  hypothetical protein  27.84 
 
 
322 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000102357  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3714  hypothetical protein  27.84 
 
 
315 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000001291  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2664  methyltransferase type 11  31.36 
 
 
210 aa  53.1  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000744585  normal  0.0352829 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3407  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  27.84 
 
 
322 aa  52.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000119678  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2036  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 
268 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3687  hypothetical protein  27.27 
 
 
315 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  37.23 
 
 
239 aa  52.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
216 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3356  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  26.26 
 
 
318 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000127941  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  32.2 
 
 
268 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363598  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  29.41 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  30.85 
 
 
194 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1969  methyltransferase type 11  27.43 
 
 
214 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00620087  normal  0.0463791 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  33.98 
 
 
221 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  27.85 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  30.15 
 
 
194 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 
216 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1044  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 
228 aa  51.2  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3341  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
315 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506511  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2987  Methyltransferase type 11  33.7 
 
 
290 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3682  hypothetical protein  26.26 
 
 
315 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000635868  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  27.78 
 
 
194 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  32.38 
 
 
258 aa  50.4  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.06 
 
 
203 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  32.65 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.71 
 
 
231 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0190  methyltransferase type 11  30.93 
 
 
184 aa  49.7  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.561898 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
276 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  34.34 
 
 
262 aa  49.7  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  27.04 
 
 
325 aa  49.7  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  29.91 
 
 
216 aa  49.7  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4780  methyltransferase type 11  30 
 
 
256 aa  49.3  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0464151  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0151  methyltransferase type 12  36.67 
 
 
491 aa  49.3  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.319391  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.36 
 
 
236 aa  49.7  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0010  Methyltransferase type 11  31.18 
 
 
248 aa  48.9  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 
247 aa  48.9  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  32.67 
 
 
204 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1821  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  27.81 
 
 
269 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000864083  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.36 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1912  23S rRNA methyltransferase A  27.81 
 
 
269 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118014  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3495  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.43 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0172261  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.06 
 
 
260 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.94 
 
 
205 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0189  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 
213 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14372  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4330  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.99 
 
 
236 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.249898  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2298  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 
306 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.490021 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  34.04 
 
 
299 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2049  23S rRNA methyltransferase A  28.4 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258454  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  32.98 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2087  23S rRNA methyltransferase A  27.81 
 
 
269 aa  48.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000369097  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  33.33 
 
 
267 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  31.13 
 
 
347 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0647  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.82 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00193935  hitchhiker  0.00940786 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
235 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.37 
 
 
229 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  30.39 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1735  hypothetical protein  31.73 
 
 
178 aa  47.4  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1203  hypothetical protein  28.18 
 
 
239 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.322275  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1676  putative methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine (SAM)-MTase protein  29.79 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1978  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  38.03 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000355132  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  27.41 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  30.69 
 
 
204 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  31.03 
 
 
352 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  30.89 
 
 
224 aa  47.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  29.47 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2214  23S rRNA methyltransferase A  26.58 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000260079  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 
310 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  29.63 
 
 
241 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  32.61 
 
 
209 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  30.67 
 
 
236 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  33.94 
 
 
204 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  35.11 
 
 
202 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1367  23S rRNA methyltransferase A  34.12 
 
 
269 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000667026  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1846  methyltransferase type 11  35.87 
 
 
195 aa  46.6  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.441849  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03053  23S rRNA methyltransferase A  28.28 
 
 
317 aa  46.6  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>