More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3363 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 1288 aa  2660    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  46.51 
 
 		 377 aa  338  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  34.89 
 
 		 369 aa  194  9e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4090  radical SAM domain-containing protein  32.17 
 
 		 462 aa  174  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0422  Methyltransferase type 11  40.17 
 
 		 270 aa  174  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731942  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1134  putative Fe-S oxidoreductase  28.5 
 
 		 425 aa  162  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  27.53 
 
 		 470 aa  149  4.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  29.04 
 
 		 488 aa  147  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  27.9 
 
 		 459 aa  141  8.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  29.04 
 
 		 487 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3359  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 		 539 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  26.81 
 
 		 471 aa  127  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3401  Radical SAM domain protein  25.29 
 
 		 484 aa  124  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3608  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 		 459 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  28.36 
 
 		 489 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  26.26 
 
 		 529 aa  119  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1693  radical SAM family protein  27.07 
 
 		 467 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1338  radical SAM/B12 binding domain protein  25.11 
 
 		 494 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_101  radical SAM/B12 binding domain protein  25.11 
 
 		 494 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2433  radical SAM domain-containing protein  26.05 
 
 		 502 aa  116  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2894  radical SAM family protein  28.79 
 
 		 613 aa  115  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0108  radical SAM domain-containing protein  23.19 
 
 		 494 aa  114  9e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2416  radical SAM domain-containing protein  27.99 
 
 		 469 aa  113  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  25.44 
 
 		 533 aa  113  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  26.68 
 
 		 520 aa  110  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2435  radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 		 524 aa  111  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000772503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0279  radical SAM domain-containing protein  24.84 
 
 		 494 aa  110  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3195  Radical SAM domain protein  25.65 
 
 		 552 aa  110  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554212 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2434  radical SAM domain-containing protein  27.81 
 
 		 520 aa  108  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1742  radical SAM domain-containing protein  27.85 
 
 		 521 aa  108  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1602  radical SAM family Fe-S protein  24.21 
 
 		 487 aa  107  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0762  Fe-S oxidoreductase  25.46 
 
 		 484 aa  107  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  28.07 
 
 		 512 aa  107  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  24.66 
 
 		 461 aa  103  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  27.72 
 
 		 424 aa  103  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2628  radical SAM domain-containing protein  28.26 
 
 		 537 aa  103  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0879  radical SAM family Fe-S protein  26.57 
 
 		 488 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 451 aa  102  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  24.43 
 
 		 441 aa  102  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  31.17 
 
 		 424 aa  102  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  29.35 
 
 		 450 aa  101  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.98 
 
 		 441 aa  100  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  25.65 
 
 		 459 aa  100  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  25.84 
 
 		 444 aa  99.8  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1119  radical SAM domain-containing protein  24.36 
 
 		 525 aa  99.4  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0138505  normal  0.560391 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3504  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  29.7 
 
 		 677 aa  99  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1864  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.06 
 
 		 565 aa  99.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  26.6 
 
 		 472 aa  98.6  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2393  radical SAM domain-containing protein  24.48 
 
 		 490 aa  97.8  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.386797  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0909  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  25.46 
 
 		 681 aa  97.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1463  radical SAM domain-containing protein  24.17 
 
 		 528 aa  97.1  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  28.87 
 
 		 473 aa  96.7  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  24.81 
 
 		 556 aa  97.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  24.08 
 
 		 460 aa  97.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1584  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.63 
 
 		 527 aa  96.3  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  24.94 
 
 		 518 aa  96.3  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1590  Radical SAM domain protein  24.32 
 
 		 488 aa  95.9  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0238  radical SAM domain-containing protein  24.52 
 
 		 461 aa  95.5  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140637  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1168  radical SAM family protein  22.06 
 
 		 566 aa  95.5  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0876  radical SAM family Fe-S protein  25 
 
 		 461 aa  93.6  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0797  Radical SAM domain protein  27.16 
 
 		 489 aa  93.6  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0353  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  24.3 
 
 		 485 aa  94  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.90319 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1625  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  26.03 
 
 		 558 aa  92.8  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2637  putative anaerobic magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester [oxidative] cyclase  24.83 
 
 		 547 aa  93.2  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.166489 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 		 472 aa  92.8  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.53 
 
 		 473 aa  92.4  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4225  radical SAM domain-containing protein  30.19 
 
 		 576 aa  92  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  23.93 
 
 		 864 aa  91.3  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0820  Radical SAM domain protein  29.72 
 
 		 583 aa  90.9  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0875  radical SAM family Fe-S protein  24.62 
 
 		 495 aa  91.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2479  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  25.12 
 
 		 484 aa  91.3  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.515921  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0030  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.98 
 
 		 647 aa  90.5  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0873  radical SAM family Fe-S protein  23.84 
 
 		 501 aa  90.1  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.32 
 
 		 476 aa  90.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  26.58 
 
 		 484 aa  90.9  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0454  radical SAM domain-containing protein  30.19 
 
 		 576 aa  90.5  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2929  radical SAM domain-containing protein  25.87 
 
 		 497 aa  90.5  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 		 468 aa  89.7  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3863  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.66 
 
 		 580 aa  90.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582854  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0942  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24 
 
 		 528 aa  89.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6404  Mg-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase 66kD subunit  24.09 
 
 		 534 aa  89.4  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2577  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  27.25 
 
 		 674 aa  89.4  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.451691  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  26.1 
 
 		 554 aa  89  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.53 
 
 		 473 aa  89  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3553  Radical SAM domain protein  24.01 
 
 		 474 aa  89.4  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2450  radical SAM domain-containing protein  28.04 
 
 		 590 aa  88.6  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00191  Mg-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase  25.69 
 
 		 506 aa  87  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  26.09 
 
 		 472 aa  87.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2336  radical SAM family Fe-S protein  24.11 
 
 		 553 aa  87.4  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2407  radical SAM domain-containing protein  23.22 
 
 		 471 aa  86.7  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1976  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.25 
 
 		 546 aa  86.7  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.175578  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 		 476 aa  86.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2315  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.6 
 
 		 546 aa  86.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.03087  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2888  B12 binding /radical SAM domain-containing protein  23.74 
 
 		 503 aa  85.9  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1668  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.47 
 
 		 612 aa  86.3  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0607785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1487  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.15 
 
 		 567 aa  86.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3548  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.93 
 
 		 535 aa  85.5  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  23.51 
 
 		 476 aa  85.5  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393045  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0047  Fe-S oxidoreductase  23.43 
 
 		 647 aa  85.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3339  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 		 555 aa  85.1  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>