More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28450 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 		 325 aa  667    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  79.05 
 
 		 331 aa  511  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  71.25 
 
 		 324 aa  471  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  73.57 
 
 		 320 aa  472  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  67.39 
 
 		 328 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  67.39 
 
 		 328 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  67.39 
 
 		 328 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  67.5 
 
 		 332 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  66.56 
 
 		 341 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  65.83 
 
 		 327 aa  430  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4848  Methyltransferase type 11  68.85 
 
 		 310 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  39.62 
 
 		 310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  34.27 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2807  Methyltransferase type 11  42.72 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.39 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.89 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2605  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.15 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0775549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  40.2 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2834  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 203 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0713675 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  41.35 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.05 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  40.2 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  39.81 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  40.2 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.59 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  38.68 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.51 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.19 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  40.38 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0895  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.43 
 
 		 220 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195725 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  31.38 
 
 		 283 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0932  putative methyltransferase  41.35 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  37.62 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3775  hypothetical protein  26.98 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  40.28 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  39.05 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  40.2 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  31.58 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  39.05 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.5 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1848  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  40.2 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.329247 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 268 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1936  methyltransferase type 11  34.42 
 
 		 213 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227883  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3328  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  41.18 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.35 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  32.61 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2635  Methyltransferase type 11  37.17 
 
 		 199 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  33.13 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  33.13 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  33.1 
 
 		 1014 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.9 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  35.83 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2014  methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.51029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  27.01 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0543  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  39.6 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.19 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0474  methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00410704  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.08 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.19 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.19 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  31.39 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  39.22 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.19 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02547  polyketide synthase, putative (Eurofung)  30.06 
 
 		 2534 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 259 aa  62  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.33 
 
 		 236 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.6 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  37.5 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  37.38 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 259 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  39.22 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  33.99 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  39 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>