More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2634 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  100 
 
 
204 aa  423  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  98.53 
 
 
204 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  98.53 
 
 
204 aa  417  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  98.04 
 
 
204 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  79.6 
 
 
204 aa  347  5e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  79.1 
 
 
204 aa  342  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  78.11 
 
 
204 aa  341  5e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  76.62 
 
 
204 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  76.96 
 
 
205 aa  331  4e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  50 
 
 
202 aa  204  9e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  40.32 
 
 
203 aa  136  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2862  methyltransferase type 11  37.23 
 
 
207 aa  131  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19610  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.95 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0633091  normal  0.0668245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3244  methyltransferase type 11  39.67 
 
 
208 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596392  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5739  methyltransferase type 11  40.11 
 
 
208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  36.22 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  33.84 
 
 
198 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  33.84 
 
 
198 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  31.85 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  32.48 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  32.39 
 
 
244 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  29.3 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  36.18 
 
 
196 aa  74.7  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  31.45 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  34.11 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.62 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  31.72 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  39.81 
 
 
332 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  40.78 
 
 
327 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  38.53 
 
 
209 aa  72  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  39.81 
 
 
341 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  39.81 
 
 
328 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  39.81 
 
 
328 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  39.81 
 
 
328 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  33.96 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  32.96 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2635  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  28.85 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  40.2 
 
 
320 aa  70.1  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  31.33 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2376  Methyltransferase type 11  32.91 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578401  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  28.66 
 
 
263 aa  68.6  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  37.27 
 
 
240 aa  68.2  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  33.93 
 
 
201 aa  67.8  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  42.57 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  29.38 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.93 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  31.08 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  37.6 
 
 
273 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  31.28 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  29.49 
 
 
242 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  29.49 
 
 
242 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  31.06 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  28.16 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.92 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  34.43 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  34.67 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 
269 aa  65.1  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 
634 aa  65.1  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 
457 aa  65.1  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 
328 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 
265 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  29.14 
 
 
287 aa  65.1  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  27.22 
 
 
226 aa  64.7  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 
239 aa  64.7  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.24 
 
 
280 aa  64.7  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 
237 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  37.1 
 
 
253 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  33.94 
 
 
168 aa  63.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
348 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  31.19 
 
 
238 aa  64.3  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.62 
 
 
213 aa  63.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  34.29 
 
 
392 aa  64.3  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  26.67 
 
 
829 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.82 
 
 
266 aa  64.3  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 
237 aa  64.3  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  28.18 
 
 
285 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  30.77 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 
220 aa  63.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  31.13 
 
 
258 aa  63.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 
250 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 
283 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  34.35 
 
 
231 aa  63.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.38 
 
 
223 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  28 
 
 
258 aa  63.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.6 
 
 
325 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  36.19 
 
 
263 aa  63.5  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  36.19 
 
 
263 aa  63.5  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  36.19 
 
 
263 aa  63.5  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  29.75 
 
 
307 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  31.78 
 
 
270 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  33.96 
 
 
265 aa  63.2  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
275 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  30.84 
 
 
295 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
271 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  28.68 
 
 
306 aa  62.8  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>