More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2478 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  100 
 
 
269 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  86.42 
 
 
266 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  71.43 
 
 
273 aa  391  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  52.65 
 
 
270 aa  268  8.999999999999999e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2080  methyltransferase type 11  39.92 
 
 
265 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.517961 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  39.23 
 
 
248 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  38.02 
 
 
264 aa  159  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1967  methyltransferase type 11  38.65 
 
 
274 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.527194  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  36.68 
 
 
248 aa  148  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  36.68 
 
 
248 aa  148  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  35.66 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4330  methyltransferase type 11  36.29 
 
 
248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.510233  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3487  methyltransferase type 11  39.62 
 
 
253 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.703718  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3639  Methyltransferase type 11  38.78 
 
 
253 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1915  methyltransferase type 11  35.85 
 
 
267 aa  142  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0565033  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  39.39 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1676  putative methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine (SAM)-MTase protein  33.58 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4115  putative methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine (SAM)-MTase protein  32.95 
 
 
272 aa  139  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
252 aa  139  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2043  methyltransferase type 11  36.02 
 
 
249 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1424  Methyltransferase type 11  38.02 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3571  Methyltransferase type 11  38.02 
 
 
253 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.103382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1519  Methyltransferase type 11  36.12 
 
 
267 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2439  methyltransferase type 11  37.34 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2133  methyltransferase type 11  32.7 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.917807  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1804  methyltransferase type 11  39.53 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1851  methyltransferase type 11  39.53 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1785  methyltransferase type 11  39.53 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0456688  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  36.5 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  40.91 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  34.43 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  43.12 
 
 
233 aa  75.5  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  35.43 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
225 aa  75.1  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  35.43 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  35.43 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  34.86 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  36.96 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  36.8 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2287  methyltransferase type 11  38.14 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108281  normal  0.170198 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  39.5 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  37.59 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  40.91 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  44.76 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  34.62 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4254  UbiE/COQ5 methyltransferase  43.14 
 
 
272 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  31.86 
 
 
168 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  29 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  36.52 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11780  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.76 
 
 
262 aa  72  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  35.97 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  39.06 
 
 
278 aa  72  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  34.13 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  37.23 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0522  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  33.83 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5049  methyltransferase type 11  27.57 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300212  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  34.13 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.06 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4063  methyltransferase type 11  35.38 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0503  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.28 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  39.47 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  29.47 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  30.2 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.58 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2397  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000574494  decreased coverage  0.000150553 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  38.21 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  38.79 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.29 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  33.83 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  31.52 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2500  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126168  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1056  methyltransferase type 11  40.71 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.270016  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3328  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  38.28 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.84 
 
 
238 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  33 
 
 
226 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  39.84 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  33.91 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3367  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.02 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  34.96 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  34.26 
 
 
202 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0574  Methyltransferase type 11  28.94 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.374047 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  38.79 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  26.88 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  37.38 
 
 
200 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  37.38 
 
 
200 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1282  methyltransferase type 11  39.25 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  29.94 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  45.74 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  36.55 
 
 
189 aa  67  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>