More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2043 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2043  methyltransferase type 11  100 
 
 
249 aa  490  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  62.3 
 
 
252 aa  292  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  58 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  55.16 
 
 
248 aa  249  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  52 
 
 
248 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  52 
 
 
248 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4330  methyltransferase type 11  51.6 
 
 
248 aa  228  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.510233  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  45.63 
 
 
264 aa  192  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3639  Methyltransferase type 11  44.71 
 
 
253 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3487  methyltransferase type 11  44.31 
 
 
253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.703718  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  39.29 
 
 
263 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3571  Methyltransferase type 11  41.9 
 
 
253 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.103382  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  36.02 
 
 
269 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  34.1 
 
 
266 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1915  methyltransferase type 11  34.52 
 
 
267 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0565033  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  35.69 
 
 
270 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1676  putative methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine (SAM)-MTase protein  36.69 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1967  methyltransferase type 11  38.8 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.527194  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  33.07 
 
 
273 aa  115  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4115  putative methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine (SAM)-MTase protein  32.28 
 
 
272 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2080  methyltransferase type 11  33.59 
 
 
265 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.517961 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2133  methyltransferase type 11  29.27 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.917807  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1424  Methyltransferase type 11  34.77 
 
 
267 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1519  Methyltransferase type 11  33.73 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2439  methyltransferase type 11  33.48 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  37.88 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  38.33 
 
 
273 aa  75.5  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  42.06 
 
 
270 aa  72  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  39.68 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  35.16 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0574  Methyltransferase type 11  31.6 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.374047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  34.03 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  39.42 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  28.96 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  38.24 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  34.71 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  42.57 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  34.71 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  25.25 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  30.89 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2889  methyltransferase type 11  34.48 
 
 
273 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000212071 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  43.14 
 
 
296 aa  64.7  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  31.43 
 
 
272 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  34.71 
 
 
239 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  43.14 
 
 
264 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  41.75 
 
 
275 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  28.96 
 
 
284 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  33.33 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  38.52 
 
 
243 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  32.2 
 
 
270 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  38 
 
 
307 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  39.6 
 
 
272 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.03 
 
 
215 aa  62.8  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  38.64 
 
 
269 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  36.8 
 
 
228 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.57 
 
 
282 aa  62  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  31.97 
 
 
260 aa  62  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.45 
 
 
213 aa  62  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  32.65 
 
 
251 aa  62  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  40.78 
 
 
265 aa  62  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 
285 aa  62  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  39.45 
 
 
257 aa  61.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
348 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  31.97 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  31.97 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  41.11 
 
 
299 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.52 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  31.97 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  27.97 
 
 
277 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  36.03 
 
 
242 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
262 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.5 
 
 
261 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  38.71 
 
 
240 aa  59.7  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  29.39 
 
 
258 aa  59.3  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  31.29 
 
 
251 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  31.29 
 
 
251 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.94 
 
 
258 aa  59.3  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0910  methyltransferase type 11  34.96 
 
 
226 aa  58.9  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.105368  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  31.29 
 
 
251 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  31.29 
 
 
251 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  31.29 
 
 
251 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1056  methyltransferase type 11  34.91 
 
 
221 aa  58.9  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.270016  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0425  trans-aconitate 2-methyltransferase  41.9 
 
 
254 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.500195  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.46 
 
 
245 aa  58.5  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  33.6 
 
 
312 aa  58.5  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  27.24 
 
 
281 aa  58.5  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 
254 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.62 
 
 
236 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  33.83 
 
 
259 aa  58.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  34.09 
 
 
255 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.75 
 
 
225 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  35.92 
 
 
257 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  35.2 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  32.17 
 
 
278 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  36.52 
 
 
305 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  35.8 
 
 
239 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  29.89 
 
 
282 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  44.57 
 
 
252 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>