More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1635 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  100 
 
 
252 aa  494  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2043  methyltransferase type 11  62.3 
 
 
249 aa  292  4e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  58 
 
 
253 aa  263  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  55.56 
 
 
248 aa  248  6e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  50.8 
 
 
248 aa  228  8e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  50.8 
 
 
248 aa  228  8e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4330  methyltransferase type 11  49.6 
 
 
248 aa  222  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.510233  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  48.02 
 
 
264 aa  205  5e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3639  Methyltransferase type 11  45.67 
 
 
253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3487  methyltransferase type 11  46.06 
 
 
253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.703718  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3571  Methyltransferase type 11  46.46 
 
 
253 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.103382  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  37.16 
 
 
266 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
269 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  34.92 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1915  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
267 aa  128  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0565033  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1676  putative methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine (SAM)-MTase protein  36.99 
 
 
268 aa  125  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4115  putative methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine (SAM)-MTase protein  35.02 
 
 
272 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  35.38 
 
 
273 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1967  methyltransferase type 11  38.8 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.527194  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2133  methyltransferase type 11  32.83 
 
 
262 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.917807  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 
270 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1424  Methyltransferase type 11  35.94 
 
 
267 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2080  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
265 aa  92  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.517961 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1519  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2439  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
266 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  40.91 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  46.43 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  40.87 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  34.65 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  29.53 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  41.41 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  37.5 
 
 
270 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  36.7 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  30.26 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  29.44 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  40.78 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  41.82 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  38.39 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  32.75 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  26.82 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  42.2 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.09 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  39.22 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  27.94 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  39.6 
 
 
269 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  35.4 
 
 
251 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 
272 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  34.78 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  34.78 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  34.86 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  30.38 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  30.84 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  29.31 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  34.78 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  42.98 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2312  Methyltransferase type 11  30.5 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0759855  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  31.76 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  32.53 
 
 
281 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  37.29 
 
 
239 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2889  methyltransferase type 11  35.94 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000212071 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  35.17 
 
 
265 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.22 
 
 
296 aa  65.1  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  34.16 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  34.16 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  34.16 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.6 
 
 
285 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3460  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.2 
 
 
253 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 
260 aa  64.3  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  40.2 
 
 
240 aa  63.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  32.97 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 
281 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 
275 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  34.16 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  34.16 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2807  Methyltransferase type 11  37.3 
 
 
228 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  37.96 
 
 
267 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.68 
 
 
273 aa  63.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 
272 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  34.78 
 
 
263 aa  63.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
235 aa  63.2  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  39.8 
 
 
256 aa  62.8  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  31.58 
 
 
253 aa  62.8  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3142  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 
248 aa  62.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3929  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.3 
 
 
269 aa  62.8  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  27.16 
 
 
246 aa  62.8  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  35.87 
 
 
197 aa  62.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  33.77 
 
 
312 aa  62.8  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  36.45 
 
 
261 aa  62.4  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  45.19 
 
 
252 aa  62.4  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  35.4 
 
 
251 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
239 aa  62.4  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  32.31 
 
 
228 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1015  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 
213 aa  62  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371605  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  35.4 
 
 
251 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.2 
 
 
244 aa  62.4  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  32.21 
 
 
287 aa  62  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6478  methyltransferase type 11  39.09 
 
 
269 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0560724  normal  0.10851 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4839  putative methyltransferase  32.46 
 
 
271 aa  62  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>