More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2397 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2397  Methyltransferase type 11  100 
 
 
273 aa  545  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000574494  decreased coverage  0.000150553 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1851  methyltransferase type 11  63.46 
 
 
275 aa  318  7e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1804  methyltransferase type 11  63.46 
 
 
275 aa  318  7e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1785  methyltransferase type 11  63.46 
 
 
275 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0456688  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0522  Methyltransferase type 11  57.14 
 
 
280 aa  286  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  56.59 
 
 
274 aa  280  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1059  methyltransferase type 11  56.46 
 
 
283 aa  279  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2287  methyltransferase type 11  59.06 
 
 
282 aa  278  5e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108281  normal  0.170198 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11432  methyltransferase  54.81 
 
 
274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000106328  normal  0.345839 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4060  methyltransferase type 11  59.18 
 
 
278 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197976  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1928  methyltransferase type 11  58.67 
 
 
284 aa  268  8e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  55.04 
 
 
266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4233  Methyltransferase type 11  55.06 
 
 
274 aa  237  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  42.42 
 
 
270 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2229  methyltransferase type 11  41.73 
 
 
276 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  44.8 
 
 
252 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  46.46 
 
 
252 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  44.4 
 
 
250 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1590  Methyltransferase type 11  43.56 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  40.98 
 
 
277 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2776  methyltransferase type 11  41.05 
 
 
279 aa  166  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  37.97 
 
 
277 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1601  methyltransferase type 11  45.02 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2092  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.46 
 
 
270 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05447  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  40 
 
 
270 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 
287 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  40.75 
 
 
287 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.96 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  36.15 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2268  methyltransferase type 11  43.24 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1610  Methyltransferase type 11  35.32 
 
 
274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  35.77 
 
 
270 aa  132  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 
280 aa  132  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 
273 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5049  methyltransferase type 11  32.22 
 
 
273 aa  112  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300212  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  39.06 
 
 
275 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  40.22 
 
 
253 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4208  Methyltransferase type 11  40.33 
 
 
271 aa  96.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195862  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  38.5 
 
 
269 aa  94  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  38.22 
 
 
269 aa  94  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3929  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.14 
 
 
269 aa  89.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  31.4 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.84 
 
 
236 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  43.81 
 
 
581 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  38.18 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0466  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.27 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0289  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  37.27 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.27 
 
 
258 aa  75.9  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.39 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.05 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  36.89 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0777  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.39 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.974721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0763  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.39 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.1 
 
 
231 aa  72  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0757  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.5 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1897  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.5 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.120045  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.67 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179927  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  38 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.89 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  37.33 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_002978  WD0393  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  31.2 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10568  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.38 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0587656  normal  0.225311 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.89 
 
 
250 aa  69.7  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4884  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.29 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.321775  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  35.78 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.197938  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0265  demethylmenaquinone methyltransferase  39.05 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3792  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.87 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.93 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.35 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1009  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00745554  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5011  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.22 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0454  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.22 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0799871  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1602  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.3 
 
 
247 aa  68.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.5 
 
 
240 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5061  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.22 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  36.75 
 
 
239 aa  68.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4885  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.22 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  39.05 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  40 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  31.47 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0860  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.03 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0650412 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.82 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.99 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3028  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  40.91 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.57312  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.33 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.97 
 
 
251 aa  67  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4785  Methyltransferase type 11  35.88 
 
 
267 aa  67  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3373  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.81 
 
 
251 aa  67  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1338  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  28.93 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.95 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0007  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  28.93 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2593  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.7 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00547032  decreased coverage  0.0000000226487 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.07 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  37.37 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>