More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1125 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  100 
 
 
270 aa  556  1e-157  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  40.91 
 
 
274 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  39.19 
 
 
269 aa  187  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 
274 aa  177  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  36.6 
 
 
273 aa  174  9e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.55 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  33.83 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4839  putative methyltransferase  35.75 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  35.95 
 
 
263 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 
253 aa  94  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  36.3 
 
 
263 aa  92.4  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  36.3 
 
 
263 aa  92.4  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  36.3 
 
 
263 aa  92.4  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  27.19 
 
 
268 aa  89  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  24.35 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  36.8 
 
 
524 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  26.78 
 
 
252 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  35.2 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.94 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 
252 aa  79  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.39 
 
 
241 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  29.85 
 
 
215 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.05 
 
 
215 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.39 
 
 
241 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0713  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  37.38 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.919448  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  33.07 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  35.04 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0688  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  36.7 
 
 
362 aa  76.6  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  26.18 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  34.56 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  36.8 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3960  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.18 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  34.48 
 
 
269 aa  75.5  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  34.72 
 
 
243 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  35.54 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  36.97 
 
 
213 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0323  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  38.89 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  36.84 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.9 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  23.65 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.74 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4209  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  37.96 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.61 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4146  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.27 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.71 
 
 
241 aa  73.6  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.86 
 
 
373 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  27.17 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4305  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.27 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4175  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.27 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3809  Methyltransferase type 11  25.88 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4057  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.27 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4216  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.27 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227535 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5274  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.27 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.123369  normal  0.211011 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4354  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.27 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.556022  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3760  Methyltransferase type 11  25.88 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  28.97 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.23 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  37.39 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  37.93 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0896  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  35.78 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  28.05 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  34.33 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  31.85 
 
 
355 aa  72.4  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  36.44 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  34.86 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4297  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.27 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.27 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.962772  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4357  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.27 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.27 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4250  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.27 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.43 
 
 
255 aa  72  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0402  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.89 
 
 
254 aa  72  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.866144  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  30.91 
 
 
238 aa  72  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3945  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.11 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.11 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  29.44 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.81 
 
 
256 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.11 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.29 
 
 
238 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1915  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0565033  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  33.9 
 
 
263 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  27.37 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
239 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03675  hypothetical protein  36.36 
 
 
251 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.03 
 
 
234 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3915  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.04 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  35.09 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0387  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.81 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  32.73 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.45 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  36.52 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>