More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5049 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_5049  methyltransferase type 11  100 
 
 		 273 aa  560  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2229  methyltransferase type 11  36.26 
 
 		 276 aa  161  9e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  34.5 
 
 		 277 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2776  methyltransferase type 11  35.25 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1590  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 279 aa  148  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  33.97 
 
 		 277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  38.06 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  37.45 
 
 		 287 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  32.68 
 
 		 273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2092  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.98 
 
 		 270 aa  132  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1785  methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0456688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1601  methyltransferase type 11  36.29 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1804  methyltransferase type 11  34.7 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1851  methyltransferase type 11  34.7 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 270 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0522  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  32.94 
 
 		 252 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  32.22 
 
 		 274 aa  122  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 250 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 252 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2268  methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2397  Methyltransferase type 11  31.6 
 
 		 273 aa  115  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000574494  decreased coverage  0.000150553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11432  methyltransferase  35.12 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000106328  normal  0.345839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1610  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4233  Methyltransferase type 11  32.55 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 266 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  26.38 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2287  methyltransferase type 11  29.56 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108281  normal  0.170198 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.3 
 
 		 272 aa  106  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4060  methyltransferase type 11  32.82 
 
 		 278 aa  105  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1928  methyltransferase type 11  30.18 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1059  methyltransferase type 11  28.14 
 
 		 283 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 266 aa  99  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  40 
 
 		 230 aa  88.6  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  40.44 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  40.44 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.82 
 
 		 241 aa  86.3  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.82 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.82 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  32.94 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.87 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3776  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.75 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0393069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1437  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.59 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1569  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.75 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3929  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.65 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.9 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.9 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.9 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.9 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.9 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.9 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.9 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.9 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  38.98 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  41.9 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4208  Methyltransferase type 11  34.01 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195862  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  30.81 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1999  2-heptaprenyl-1,4- naphthoquinonemethyltransferas e  33.33 
 
 		 235 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.753273  normal  0.375757 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  37.7 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  36.94 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  38.33 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2653  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.86 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  40.37 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  40.38 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.38 
 
 		 237 aa  75.5  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  32.03 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  34.56 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39.05 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  27.57 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1774  methyltransferase type 11  39.33 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.83 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.84 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  26.64 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  40.52 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  29.59 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.43 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  31.15 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 581 aa  72.4  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  36.29 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3003  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.96 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  27.19 
 
 		 266 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.84 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  35.14 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3028  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  30.95 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.57312  normal  0.365128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>