More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2831 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  100 
 
 
270 aa  553  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  70 
 
 
270 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2092  UbiE/COQ5 methyltransferase  73.33 
 
 
270 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05447  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  61.51 
 
 
277 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1590  Methyltransferase type 11  58.49 
 
 
279 aa  323  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  58.02 
 
 
277 aa  323  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2776  methyltransferase type 11  59.62 
 
 
279 aa  322  5e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2229  methyltransferase type 11  58.27 
 
 
276 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  60.38 
 
 
287 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  61.42 
 
 
287 aa  295  6e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1601  methyltransferase type 11  58.11 
 
 
286 aa  288  9e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2268  methyltransferase type 11  61.42 
 
 
286 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  38.87 
 
 
273 aa  185  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0522  Methyltransferase type 11  41.49 
 
 
280 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4233  Methyltransferase type 11  41.03 
 
 
274 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  41.88 
 
 
274 aa  168  7e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.08 
 
 
272 aa  167  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2287  methyltransferase type 11  39.62 
 
 
282 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108281  normal  0.170198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1928  methyltransferase type 11  39.27 
 
 
284 aa  159  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1785  methyltransferase type 11  40.4 
 
 
275 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0456688  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  42.68 
 
 
266 aa  159  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1804  methyltransferase type 11  40 
 
 
275 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1851  methyltransferase type 11  40 
 
 
275 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11432  methyltransferase  39.83 
 
 
274 aa  156  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000106328  normal  0.345839 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4060  methyltransferase type 11  39.48 
 
 
278 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197976  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  37.86 
 
 
250 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  37.86 
 
 
252 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  37.86 
 
 
252 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1059  methyltransferase type 11  38.06 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2397  Methyltransferase type 11  37.17 
 
 
273 aa  146  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000574494  decreased coverage  0.000150553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 
270 aa  142  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  32.21 
 
 
280 aa  136  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  34.8 
 
 
266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1610  Methyltransferase type 11  31.91 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5049  methyltransferase type 11  34.22 
 
 
273 aa  125  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300212  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  39.27 
 
 
275 aa  118  9e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  40 
 
 
253 aa  118  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  38.26 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  38.26 
 
 
269 aa  116  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3929  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.7 
 
 
269 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  38.15 
 
 
274 aa  95.5  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4208  Methyltransferase type 11  39.34 
 
 
271 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195862  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  42.03 
 
 
251 aa  89.4  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 
281 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  39.53 
 
 
239 aa  87.8  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  44.66 
 
 
581 aa  85.9  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  38.12 
 
 
283 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  31.7 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0064  Methyltransferase type 11  39.29 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1774  methyltransferase type 11  31.31 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1645  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
281 aa  79.3  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.01 
 
 
271 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 
272 aa  78.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11780  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.5 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.13 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3003  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.32 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.5 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  30.85 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  37.1 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.14 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4692  methyltransferase type 11  32.09 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  0.0428157 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  39.23 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  43.3 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.72 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.57 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.61729  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  40.54 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  36.44 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.29 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.14 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 
415 aa  72.4  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  30.22 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.05 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  39.8 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3565  Methyltransferase type 11  39.67 
 
 
288 aa  72  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  31.16 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4560  Methyltransferase type 11  32.21 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.605076 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  38.35 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3488  Methyltransferase type 11  32.21 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.299223 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.59 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1067  methyltransferase type 11  30.36 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3506  methyltransferase type 11  28 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  32.18 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  35.51 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0278  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.96 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.831577  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  42.42 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3065  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.39 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627483  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0402  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.52 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.866144  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
279 aa  68.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  41.94 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3491  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  38.32 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  30.23 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.63 
 
 
237 aa  68.6  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  37.61 
 
 
209 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0860  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  36.19 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0650412 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.07 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  40.95 
 
 
284 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  41.35 
 
 
526 aa  67  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>