More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1645 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1645  methyltransferase type 11  100 
 
 		 281 aa  568  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  34.5 
 
 		 270 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  35.2 
 
 		 270 aa  95.9  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 252 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 250 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 252 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4233  Methyltransferase type 11  35.18 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2092  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.4 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  27.87 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  33.9 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  49.02 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  42.37 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  32.62 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0522  Methyltransferase type 11  33.52 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11432  methyltransferase  33.88 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000106328  normal  0.345839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1804  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1851  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2229  methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2397  Methyltransferase type 11  32.95 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000574494  decreased coverage  0.000150553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2287  methyltransferase type 11  32.61 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108281  normal  0.170198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1785  methyltransferase type 11  31.72 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0456688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1590  Methyltransferase type 11  27.84 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1059  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  35.63 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.05 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  26.82 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1601  methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3328  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  52 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3929  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.51 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.41 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2776  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  34.32 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  34.36 
 
 		 526 aa  70.1  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.2 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.41 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.94 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  36.36 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4208  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 271 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195862  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  30.67 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.71 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  38.17 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  29.61 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  37.19 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.5 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.81 
 
 		 231 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.12 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4060  methyltransferase type 11  33.51 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  38.66 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  38.4 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4785  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  30.26 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0698  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  36.28 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  43 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0323  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  33.91 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  31.98 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1009  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00745554  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  35.9 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5049  methyltransferase type 11  24.38 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.78 
 
 		 243 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0887672  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.45 
 
 		 230 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5806  Methyltransferase type 11  30.68 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  35.82 
 
 		 269 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  30.81 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  34.35 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.58 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1928  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  35.83 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1996  generic methyltransferase  33.07 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  39.05 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3415  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.28 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.27 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28603  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  31.63 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2996  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.43 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4692  methyltransferase type 11  30.05 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  0.0428157 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.82 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2970  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.52 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2818  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.52 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2268  methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.43 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1119  MCP methyltransferase, CheR-type  31.71 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.93 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0542  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  32.17 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  32.45 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3792  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.07 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  43.36 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4115  putative methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine (SAM)-MTase protein  31.58 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0333  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.18 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.744081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  33.07 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0348  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.18 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.43472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>