More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3216 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  100 
 
 
275 aa  545  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3929  UbiE/COQ5 methyltransferase  61.94 
 
 
269 aa  296  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  60.98 
 
 
269 aa  296  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  60 
 
 
269 aa  294  9e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  39.82 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  34.96 
 
 
277 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  39.27 
 
 
270 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2229  methyltransferase type 11  38.91 
 
 
276 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  35.98 
 
 
277 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  39.21 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1601  methyltransferase type 11  39.65 
 
 
286 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  36.36 
 
 
274 aa  116  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  38.51 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  39.21 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  38.51 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  38.51 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2776  methyltransferase type 11  34.8 
 
 
279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1785  methyltransferase type 11  39.73 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0456688  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1590  Methyltransferase type 11  34.36 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.97 
 
 
272 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1804  methyltransferase type 11  39.29 
 
 
275 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1851  methyltransferase type 11  39.29 
 
 
275 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4233  Methyltransferase type 11  38.36 
 
 
274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  38.04 
 
 
266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2092  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.7 
 
 
270 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05447  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 
273 aa  105  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2397  Methyltransferase type 11  39.06 
 
 
273 aa  105  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000574494  decreased coverage  0.000150553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  43.42 
 
 
253 aa  105  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  35.91 
 
 
266 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  38.42 
 
 
270 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1610  Methyltransferase type 11  34.35 
 
 
274 aa  102  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2287  methyltransferase type 11  36.4 
 
 
282 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108281  normal  0.170198 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0522  Methyltransferase type 11  43.45 
 
 
280 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1928  methyltransferase type 11  36.6 
 
 
284 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 
272 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11432  methyltransferase  38.33 
 
 
274 aa  92  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000106328  normal  0.345839 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  38.31 
 
 
240 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  38.95 
 
 
274 aa  90.9  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  31.8 
 
 
275 aa  90.5  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  34.32 
 
 
286 aa  89.7  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  36.49 
 
 
280 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2268  methyltransferase type 11  38.16 
 
 
286 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4060  methyltransferase type 11  37.7 
 
 
278 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197976  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  31.94 
 
 
283 aa  85.5  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  29.75 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.58 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  34.66 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3676  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  38.24 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1059  methyltransferase type 11  41.5 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.62 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  35.52 
 
 
415 aa  82.8  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  30.74 
 
 
281 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  33.06 
 
 
581 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1067  methyltransferase type 11  23.37 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3003  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.5 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  35.47 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  33 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.31 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1611  methyltransferase type 11  32.05 
 
 
290 aa  77  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4208  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195862  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.29 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7094  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.03 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661752  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.29 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.36 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.76 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
210 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.1 
 
 
240 aa  75.1  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3028  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  35.42 
 
 
250 aa  75.1  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.57312  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  32.8 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.97 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.04 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10334  hypothetical protein  37.41 
 
 
208 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.672272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1774  methyltransferase type 11  35.76 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0006  hypothetical protein  41.44 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.868865  normal  0.0557095 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1973  demethylmenaquinone methyltransferase  43.97 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.48 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3491  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  35.66 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5049  methyltransferase type 11  41.9 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300212  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  32.05 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  32.46 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0732  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.62 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.88 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  38.36 
 
 
263 aa  72  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.3 
 
 
237 aa  72  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  30.38 
 
 
252 aa  72  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0064  Methyltransferase type 11  44.66 
 
 
247 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1612  Methyltransferase type 11  38.74 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227144  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0415  methyltransferase type 11  41.23 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.670256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39 
 
 
258 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.02 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0647  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00193935  hitchhiker  0.00940786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>