More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1278 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  100 
 
 		 275 aa  549  1e-155  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  39.21 
 
 		 287 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6294  methyltransferase type 11  38.57 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  39.19 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  34.89 
 
 		 285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1119  MCP methyltransferase, CheR-type  37.41 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.9 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  38.55 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  38.55 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  37.73 
 
 		 282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3054  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.96 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6529  Methyltransferase type 11  37.77 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0889937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  34.04 
 
 		 281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.92 
 
 		 285 aa  122  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  32.6 
 
 		 280 aa  122  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  34.3 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0964  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0015183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4859  methyltransferase type 11  36.69 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  32.51 
 
 		 285 aa  116  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0249  aklanonic acid methyl transferase  37 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.435744  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0036  putative methyltransferase  37 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0036  putative methyltransferase  37 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2695  hypothetical protein  37 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3270  hypothetical protein  37 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1857  hypothetical protein  37 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253741  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4043  methyltransferase type 11  36.86 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  36.1 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0533  methyltransferase type 12  32.88 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  35.38 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3562  methyltransferase type 11  36.3 
 
 		 282 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0034  methyltransferase  35.27 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1611  methyltransferase type 11  33.2 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2312  Methyltransferase type 11  36.8 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0759855  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5806  Methyltransferase type 11  32.47 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4627  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  32.87 
 
 		 291 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951338  decreased coverage  0.00842858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0868  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321249  hitchhiker  0.00411338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2838  methyltransferase type 11  33.21 
 
 		 285 aa  99.8  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1612  Methyltransferase type 11  42.75 
 
 		 255 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227144  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1991  Methyltransferase type 11  31 
 
 		 283 aa  96.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306887  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  32.37 
 
 		 286 aa  97.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6582  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 259 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156331  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5806  Methyltransferase type 11  36.1 
 
 		 275 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3804  methyltransferase type 11  40.4 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1974  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00383386  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0245  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.744046  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 266 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1849  Methyltransferase type 11  32.66 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.42 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  32.68 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.01 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  28.62 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.06 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.911002 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.29 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1769  Methyltransferase type 11  32.16 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2216  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.88 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414358  normal  0.438361 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.65 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2107  methyltransferase type 11  32.82 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  28.91 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 226 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  25.49 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3371  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.34 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362106 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.38 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2522  methyltransferase type 11  27.82 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0274503  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.32 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4785  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3565  Methyltransferase type 11  27.84 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  41.3 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.19 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.21 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2545  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.19 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229105 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  30.81 
 
 		 581 aa  62.4  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.01 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  30.05 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0786  hypothetical protein  31.93 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.27206  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  40.57 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  41.11 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  38.68 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4775  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.76 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3392  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.76 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4124  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.76 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  40.57 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  33.86 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  27.14 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2425  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.58 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3170  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.51 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.781198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  40.22 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.43 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3488  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.299223 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4560  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.605076 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.93 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>