More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6077 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  100 
 
 
277 aa  573  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  74.1 
 
 
277 aa  434  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2229  methyltransferase type 11  64.96 
 
 
276 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1590  Methyltransferase type 11  62.69 
 
 
279 aa  353  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2776  methyltransferase type 11  61.09 
 
 
279 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  60.37 
 
 
270 aa  341  9e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1601  methyltransferase type 11  65.89 
 
 
286 aa  328  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  60.15 
 
 
287 aa  311  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2092  UbiE/COQ5 methyltransferase  61.83 
 
 
270 aa  310  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05447  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  58.02 
 
 
270 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  60.54 
 
 
287 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2268  methyltransferase type 11  60 
 
 
286 aa  285  8e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  40.74 
 
 
273 aa  206  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.03 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1610  Methyltransferase type 11  38.2 
 
 
274 aa  172  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1785  methyltransferase type 11  41.48 
 
 
275 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0456688  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1804  methyltransferase type 11  40.74 
 
 
275 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1851  methyltransferase type 11  40.74 
 
 
275 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2287  methyltransferase type 11  40.86 
 
 
282 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108281  normal  0.170198 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0522  Methyltransferase type 11  39.46 
 
 
280 aa  166  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1928  methyltransferase type 11  40.67 
 
 
284 aa  166  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  43.28 
 
 
266 aa  165  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 
270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4233  Methyltransferase type 11  41.79 
 
 
274 aa  161  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  36.33 
 
 
280 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  38.61 
 
 
274 aa  153  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1059  methyltransferase type 11  37.73 
 
 
283 aa  153  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2397  Methyltransferase type 11  40.98 
 
 
273 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000574494  decreased coverage  0.000150553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4060  methyltransferase type 11  39.41 
 
 
278 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197976  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5049  methyltransferase type 11  34.5 
 
 
273 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300212  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11432  methyltransferase  36.84 
 
 
274 aa  142  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000106328  normal  0.345839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  33.47 
 
 
252 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  33.06 
 
 
252 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  33.06 
 
 
250 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 
266 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  44.02 
 
 
253 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  36.4 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  34.59 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  35.98 
 
 
269 aa  116  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3929  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.96 
 
 
269 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4208  Methyltransferase type 11  33.2 
 
 
271 aa  98.6  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195862  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  40.29 
 
 
274 aa  93.6  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  27.02 
 
 
281 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  46.15 
 
 
581 aa  89  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  36.96 
 
 
251 aa  85.5  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.81 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.36 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2889  methyltransferase type 11  37.36 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000212071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  30.24 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  34.92 
 
 
272 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1347  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.72 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  37.21 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.39 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  37.72 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.58 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1774  methyltransferase type 11  32.42 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_002950  PG1870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.31 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3003  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.48 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.61 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.36 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179927  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  40.78 
 
 
215 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1645  methyltransferase type 11  27.46 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0064  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3492  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  39.81 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11780  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  45 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.72 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.54 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  44 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  34.09 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.41 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4209  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  32.09 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  36.04 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2735  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  41.28 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0158342 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.83 
 
 
237 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1317  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.9 
 
 
263 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
251 aa  72  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.71 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.83 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.83 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.83 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3792  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.92 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2970  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.58 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  37.19 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0402  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.83 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.866144  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.83 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.83 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.79 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.83 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1437  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.58 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1569  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.83 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0466  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.17 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  35.54 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  35.29 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  35.71 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  35.54 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1004  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.95 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.202483  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  35.54 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>