More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1032 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  100 
 
 		 282 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  97.16 
 
 		 282 aa  551  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0964  Methyltransferase type 11  80.36 
 
 		 281 aa  435  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0015183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5806  Methyltransferase type 11  51.47 
 
 		 275 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0868  methyltransferase type 11  51.61 
 
 		 285 aa  215  7e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321249  hitchhiker  0.00411338 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  44.29 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3804  methyltransferase type 11  50.92 
 
 		 279 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0533  methyltransferase type 12  36.27 
 
 		 325 aa  186  6e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  40.14 
 
 		 285 aa  182  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  42.05 
 
 		 281 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  39.13 
 
 		 282 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  38.85 
 
 		 282 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  38.85 
 
 		 282 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4859  methyltransferase type 11  40.28 
 
 		 281 aa  171  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  42.05 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  38.93 
 
 		 285 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.94 
 
 		 282 aa  168  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1991  Methyltransferase type 11  37.1 
 
 		 283 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306887  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  41.03 
 
 		 240 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.25 
 
 		 285 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4043  methyltransferase type 11  39.35 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0036  putative methyltransferase  38.03 
 
 		 291 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3270  hypothetical protein  38.03 
 
 		 291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2695  hypothetical protein  38.03 
 
 		 291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0249  aklanonic acid methyl transferase  38.03 
 
 		 291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.435744  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1857  hypothetical protein  38.03 
 
 		 291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253741  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0036  putative methyltransferase  38.03 
 
 		 291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3054  UbiE/COQ5 methyltransferase  42.03 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0034  methyltransferase  36.88 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  36.2 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6294  methyltransferase type 11  41.99 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3562  methyltransferase type 11  39.21 
 
 		 282 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6529  Methyltransferase type 11  42.05 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0889937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2838  methyltransferase type 11  36.92 
 
 		 285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1119  MCP methyltransferase, CheR-type  41.64 
 
 		 287 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4627  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  34.53 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951338  decreased coverage  0.00842858 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2522  methyltransferase type 11  39.53 
 
 		 270 aa  149  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0274503  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1611  methyltransferase type 11  32.85 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2312  Methyltransferase type 11  37.94 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0759855  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0245  methyltransferase type 11  37.59 
 
 		 284 aa  138  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.744046  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  35.27 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  35.38 
 
 		 283 aa  132  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5806  Methyltransferase type 11  35.47 
 
 		 281 aa  115  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  35.38 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1974  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00383386  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  35.39 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1612  Methyltransferase type 11  38.02 
 
 		 255 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227144  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  32.29 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6582  Methyltransferase type 11  35.55 
 
 		 259 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156331  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  32.37 
 
 		 279 aa  89.4  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.63 
 
 		 269 aa  89  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.13 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  30.13 
 
 		 270 aa  85.9  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 526 aa  81.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.07 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  43.09 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3565  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3488  Methyltransferase type 11  33.07 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.299223 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4560  Methyltransferase type 11  33.07 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.605076 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  31.13 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  31.39 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  29.85 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3676  Methyltransferase type 11  33.14 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4254  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.43 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0597  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  30.34 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.369183  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1099  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.18 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.729785  normal  0.0384798 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1392  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5925  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.94 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  30.12 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  35.04 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.4 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2700  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.07 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14886  predicted protein  37.06 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.468238  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0333  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.52 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.744081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3792  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.59 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  34.78 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0348  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.69 
 
 		 243 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.43472 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4247  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.82 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225644  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1722  methyltransferase type 11  25.62 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0295021 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3373  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.17 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0840  Methyltransferase type 11  27.71 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.41 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4785  Methyltransferase type 11  39.22 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.7 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  25.52 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4056  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.82 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0458  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.98 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.886741 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0491  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.97 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  28.97 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3915  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.91 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1422  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.7 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>