More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0533 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0533  methyltransferase type 12  100 
 
 
325 aa  658    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  36.95 
 
 
282 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  36.27 
 
 
282 aa  186  7e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0964  Methyltransferase type 11  35.59 
 
 
281 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0015183  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  38.22 
 
 
288 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5806  Methyltransferase type 11  39.8 
 
 
275 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  34.46 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  34.67 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  31.54 
 
 
280 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.89 
 
 
285 aa  159  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4859  methyltransferase type 11  33.22 
 
 
281 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  35.55 
 
 
287 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4627  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  38.36 
 
 
291 aa  152  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951338  decreased coverage  0.00842858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3054  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.24 
 
 
290 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6294  methyltransferase type 11  36.61 
 
 
287 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6529  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0889937 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.84 
 
 
282 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3804  methyltransferase type 11  37.97 
 
 
279 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154752  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2838  methyltransferase type 11  32.9 
 
 
285 aa  142  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1119  MCP methyltransferase, CheR-type  36.21 
 
 
287 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1611  methyltransferase type 11  30.95 
 
 
290 aa  140  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  31.46 
 
 
282 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  31.46 
 
 
282 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  34.9 
 
 
240 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1857  hypothetical protein  31.46 
 
 
291 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253741  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0036  putative methyltransferase  31.25 
 
 
291 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0249  aklanonic acid methyl transferase  31.46 
 
 
291 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.435744  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0036  putative methyltransferase  31.46 
 
 
291 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2695  hypothetical protein  31.46 
 
 
291 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3270  hypothetical protein  31.46 
 
 
291 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0868  methyltransferase type 11  38.44 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321249  hitchhiker  0.00411338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
283 aa  136  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  31.1 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1991  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 
283 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306887  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0245  methyltransferase type 11  34.88 
 
 
284 aa  134  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.744046  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0034  methyltransferase  30.57 
 
 
305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  31.6 
 
 
286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4043  methyltransferase type 11  30.59 
 
 
282 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3562  methyltransferase type 11  32.12 
 
 
282 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122272  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  29.8 
 
 
284 aa  126  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  31.77 
 
 
281 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5806  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 
281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  32.88 
 
 
275 aa  110  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1974  Methyltransferase type 11  35.16 
 
 
260 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00383386  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2312  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 
275 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0759855  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2522  methyltransferase type 11  33.83 
 
 
270 aa  97.4  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0274503  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1612  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 
255 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227144  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  30.11 
 
 
251 aa  86.7  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  28.5 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  26.76 
 
 
281 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6582  Methyltransferase type 11  34.5 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156331  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
270 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3565  Methyltransferase type 11  27.45 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.13 
 
 
269 aa  77  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 
275 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1392  Methyltransferase type 11  28.02 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4254  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.31 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  28.63 
 
 
526 aa  73.6  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  29.56 
 
 
272 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.4 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  27.49 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  29.47 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.04 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  26.89 
 
 
415 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0840  Methyltransferase type 11  26.6 
 
 
272 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3694  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 
285 aa  67  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00559242  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  28.5 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  27.01 
 
 
245 aa  62.8  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  33.61 
 
 
268 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14886  predicted protein  26.61 
 
 
309 aa  62.4  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.468238  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4063  methyltransferase type 11  28.16 
 
 
271 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.22 
 
 
237 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  29.13 
 
 
279 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.21 
 
 
280 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.33 
 
 
241 aa  59.7  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 
231 aa  59.7  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1722  methyltransferase type 11  22.95 
 
 
280 aa  59.7  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0295021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3189  MCP methyltransferase, CheR-type  26.24 
 
 
297 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00181305  normal  0.0716024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  33.07 
 
 
266 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7094  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.81 
 
 
244 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661752  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3003  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.9 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  31.91 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.52 
 
 
264 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  32.43 
 
 
263 aa  58.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  32.43 
 
 
263 aa  58.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  32.43 
 
 
263 aa  58.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 
263 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  27.8 
 
 
250 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  26.97 
 
 
271 aa  57.4  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  31.49 
 
 
262 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  34 
 
 
270 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.16 
 
 
241 aa  57  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.16 
 
 
241 aa  57  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0650  methyltransferase type 11  31.47 
 
 
424 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541697  normal  0.369974 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  33.33 
 
 
249 aa  56.2  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5925  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.4 
 
 
248 aa  55.8  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2020  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
236 aa  55.8  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
256 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4023  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.59 
 
 
240 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.43 
 
 
253 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>