More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0245 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0245  methyltransferase type 11  100 
 
 
284 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.744046  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  41.01 
 
 
285 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  41.94 
 
 
285 aa  169  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.73 
 
 
285 aa  169  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  41.64 
 
 
288 aa  169  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  43.28 
 
 
240 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  37.94 
 
 
282 aa  159  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  37.59 
 
 
282 aa  155  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4627  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  39.07 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951338  decreased coverage  0.00842858 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0964  Methyltransferase type 11  40.8 
 
 
281 aa  152  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0015183  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  36.1 
 
 
280 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  37.01 
 
 
287 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.89 
 
 
282 aa  145  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0533  methyltransferase type 12  35.94 
 
 
325 aa  145  8.000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5806  Methyltransferase type 11  43.01 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2522  methyltransferase type 11  38.66 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0274503  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  39.93 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  39.93 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1991  Methyltransferase type 11  37.01 
 
 
283 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306887  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  38.41 
 
 
282 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4043  methyltransferase type 11  39.72 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  40.7 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  36.2 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3562  methyltransferase type 11  38.43 
 
 
282 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122272  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3054  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.19 
 
 
290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1119  MCP methyltransferase, CheR-type  35.23 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  39.33 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6529  Methyltransferase type 11  35.76 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0889937 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6294  methyltransferase type 11  35.44 
 
 
287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2838  methyltransferase type 11  38.8 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1611  methyltransferase type 11  34.42 
 
 
290 aa  125  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0036  putative methyltransferase  38.35 
 
 
291 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4859  methyltransferase type 11  37.88 
 
 
281 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0034  methyltransferase  37.28 
 
 
305 aa  123  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0249  aklanonic acid methyl transferase  37.99 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.435744  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2695  hypothetical protein  37.99 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3270  hypothetical protein  37.99 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1857  hypothetical protein  37.99 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253741  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0036  putative methyltransferase  37.99 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5806  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0868  methyltransferase type 11  36 
 
 
285 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321249  hitchhiker  0.00411338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3804  methyltransferase type 11  44.72 
 
 
279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154752  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
283 aa  109  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1974  Methyltransferase type 11  40.89 
 
 
260 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00383386  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2312  Methyltransferase type 11  34.7 
 
 
275 aa  99.8  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0759855  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  34.93 
 
 
291 aa  99  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  36.1 
 
 
275 aa  93.6  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  35.67 
 
 
270 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
526 aa  85.1  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  35.03 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.58 
 
 
269 aa  82  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 
415 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1612  Methyltransferase type 11  38.92 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227144  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  32.6 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  31.41 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  36.9 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1722  methyltransferase type 11  25.23 
 
 
280 aa  79  0.00000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0295021 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  41.09 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  35.11 
 
 
249 aa  79  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3694  Methyltransferase type 11  28.26 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00559242  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  27.63 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6582  Methyltransferase type 11  45.06 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156331  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  33.8 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  36.36 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.72 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  39.86 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  42.98 
 
 
265 aa  72  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4254  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.01 
 
 
272 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  33.9 
 
 
263 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.72 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.72 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14886  predicted protein  40.91 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.468238  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  36.09 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  41.32 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4785  Methyltransferase type 11  40.98 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.91 
 
 
241 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3565  Methyltransferase type 11  31.79 
 
 
288 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  30 
 
 
245 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  36.07 
 
 
278 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0323  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  35.45 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  39.07 
 
 
275 aa  67  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  32.75 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  33.62 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0461  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  33.9 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3202  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  34.48 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3792  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.62 
 
 
251 aa  65.1  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2700  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  33.62 
 
 
249 aa  65.1  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  42.75 
 
 
287 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0475  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  33.62 
 
 
251 aa  65.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1326  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.54 
 
 
247 aa  65.1  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.76 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.76 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3003  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.1 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0713  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  38.39 
 
 
374 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.919448  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  31.14 
 
 
252 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0405  demethylmenaquinone methyltransferase  32.76 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.403287  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3725  demethylmenaquinone methyltransferase  32.76 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>