More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3804 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3804  methyltransferase type 11  100 
 
 		 279 aa  534  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5806  Methyltransferase type 11  74.91 
 
 		 275 aa  347  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0964  Methyltransferase type 11  50.92 
 
 		 281 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0015183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  50.36 
 
 		 282 aa  249  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  50.18 
 
 		 282 aa  246  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0868  methyltransferase type 11  51.93 
 
 		 285 aa  199  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321249  hitchhiker  0.00411338 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  48.01 
 
 		 288 aa  199  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0533  methyltransferase type 12  39.66 
 
 		 325 aa  192  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  42.81 
 
 		 285 aa  189  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  41.67 
 
 		 285 aa  188  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3054  UbiE/COQ5 methyltransferase  43.97 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  43.82 
 
 		 287 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.49 
 
 		 285 aa  176  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  44.73 
 
 		 240 aa  173  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6529  Methyltransferase type 11  42.61 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0889937 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  36.92 
 
 		 280 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1119  MCP methyltransferase, CheR-type  43.11 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6294  methyltransferase type 11  42.61 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4627  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  39.21 
 
 		 291 aa  161  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951338  decreased coverage  0.00842858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  42.75 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1611  methyltransferase type 11  33.69 
 
 		 290 aa  148  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.82 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  37.91 
 
 		 282 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  38.63 
 
 		 282 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  38.63 
 
 		 282 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  37.91 
 
 		 283 aa  142  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0034  methyltransferase  38.77 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4859  methyltransferase type 11  36.88 
 
 		 281 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0036  putative methyltransferase  37.68 
 
 		 291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0245  methyltransferase type 11  39.93 
 
 		 284 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.744046  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0249  aklanonic acid methyl transferase  37.68 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.435744  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1857  hypothetical protein  37.68 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253741  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0036  putative methyltransferase  37.68 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3270  hypothetical protein  37.68 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2695  hypothetical protein  37.68 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2838  methyltransferase type 11  38.75 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1991  Methyltransferase type 11  35.36 
 
 		 283 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306887  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  34.64 
 
 		 284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2522  methyltransferase type 11  44.32 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0274503  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2312  Methyltransferase type 11  37.99 
 
 		 275 aa  126  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0759855  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3562  methyltransferase type 11  34.53 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5806  Methyltransferase type 11  38.63 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4043  methyltransferase type 11  34.53 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1974  Methyltransferase type 11  40.43 
 
 		 260 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00383386  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  35 
 
 		 275 aa  112  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  35.18 
 
 		 291 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1612  Methyltransferase type 11  38.16 
 
 		 255 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227144  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6582  Methyltransferase type 11  39.34 
 
 		 259 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156331  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  36.51 
 
 		 415 aa  96.3  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  36.67 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3565  Methyltransferase type 11  33.83 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  34.13 
 
 		 281 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.78 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.28 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  33.2 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.4 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1433  methyltransferase type 11  38.19 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  42.61 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  38.71 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  37.59 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  31.74 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1422  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.3 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  32.24 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  30.05 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0650  methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 424 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541697  normal  0.369974 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.78 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  30.73 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.34 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.126123  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4560  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.605076 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3488  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.299223 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1392  Methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.64 
 
 		 254 aa  72  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4254  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.52 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  26.82 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3028  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  27.84 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.57312  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.67 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4117  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  29.76 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.930509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1722  methyltransferase type 11  26.11 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0295021 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.87 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  35.63 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3506  methyltransferase type 11  31.87 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0840  Methyltransferase type 11  30.9 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  36.06 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  29.14 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  43.06 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1067  methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  35.61 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2700  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  24.62 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3915  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.93 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  38.33 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3763  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.82 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3676  Methyltransferase type 11  34.16 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0491  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.21 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3373  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.78 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  40 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3202  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  28.02 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00562  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.7 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>